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Klinische FragestellungXeroderma pigmentosum, Trichothiodystrophie/Cockayne-Syndrom; Differentialdiagnose

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Zusammenfassung

Kurzinformation

Umfassendes differentialdiagnostisches panel für Xeroderma pigmentosum [DD Trichothiodystrophie, Cockayne Syndrom] mit 10 Leitlinien-kuratierten bzw. zusammen genommen 20 kuratierten Genen gemäß klinischer Verdachtsdiagnose

ID
XP0130
Anzahl Loci
Locus-TypAnzahl
Gen 18
Akkreditierte Untersuchung
Untersuchte Sequenzlänge
25,5 kb (Core-/Core-canditate-Gene)
36,8 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
Analyse-Dauer
auf Anfrage
Untersuchungsmaterial
  • EDTA-Blut (3-5 ml)
Diagnostische Hinweise

NGS +

 

Loci

Gen

NameExon-Länge (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Erbgang
DDB21284NM_000107.3AR
ERCC1972NM_202001.3AR
ERCC22283NM_000400.4AR
ERCC32349NM_000122.2AR
ERCC42751NM_005236.3AR
ERCC53561NM_000123.4AR
ERCC64482NM_000124.4AR
ERCC81191NM_000082.4AR
GTF2H5216NM_207118.3AR
MPLKIP540NM_138701.4AR
POLH2142NM_006502.3AR
XPA822NM_000380.4AR
XPC2823NM_004628.5AR
AARS12927NM_001605.3AR
GTF2E21323NM_002095.6AR
MRE112127NM_005591.4AR
RAD503939NM_005732.4AR
RNF113A1032NM_006978.3XL

Infos zur Erkrankung

Klinischer Kommentar

Xeroderma pigmentosum (XP) ist gekennzeichnet durch: (a) akute Sonnenempfindlichkeit (schwerer Sonnenbrand mit Blasenbildung, anhaltendes Erythem bei minimaler Sonneneinstrahlung) mit ausgeprägter sommersprossenartiger Pigmentierung des Gesichts vor dem zweiten Lebensjahr; (b)sonnenlichtbedingte Augenbeteiligung (Photophobie, schwere Keratitis, Atrophie der Lidhaut, Neoplasien der Augenoberfläche); (c) stark erhöhtes Risiko für sonnenlichtbedingte Hautneoplasien (Basalzellkarzinom, Plattenepithelkarzinom, Melanom) innerhalb des ersten Lebensjahrzehnts. Etwa 25 % der Betroffenen weisen neurologische Manifestationen auf (erworbene Mikrozephalie, verminderte oder fehlende Sehnendehnungsreflexe, fortschreitender sensorineuraler Hörverlust, fortschreitende kognitive Beeinträchtigung und Ataxie). Die häufigsten Todesursachen sind Hautkrebs, neurologische Degeneration und innere Krebserkrankungen. Das mediane Sterbealter bei XP-Patienten mit Neurodegeneration (29 Jahre) ist niedriger als bei XP-Patienten ohne Neurodegeneration (37 Jahre). Die Diagnose XP wird bei einem Probanden anhand klinischer Befunde und der Familienanamnese und/oder durch die Identifizierung biallelischer pathogener Varianten in DDB2, ERCC1, ERCC2, ERCC3, ERCC4, ERCC5, POLH, XPA oder XPC gestellt. Wichtige Differentialdiagnosen sind das Cockayne-Syndrom und die Trichothiodystrophie, die durch das hier verwendete Genpanel miterfasst werden. Literatur: www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1397

 

Synonyme
  • CSA sympt.: Cachectic dwarfism, skin photosensitivity, thin hair, progeroidism, ...
  • ...progressive pigmentary retinopathy, sensorineural hearing loss, dental caries
  • Allelic: Charcot-Marie-Tooth disease, axonal, type 2N (AARS1)
  • Allelic: De Sanctis-Cacchione syndrome (ERCC6)
  • Allelic: Developmental + epileptic encephalopathy 29 (AARS1)
  • Allelic: Fanconi anemia, complementation group Q (ERCC4)
  • Allelic: Leukoencephalopathy, hereditary diffuse, with spheroids 2 (AARS1)
  • Allelic: Lung cancer, susceptibility to (ERCC6)
  • Allelic: Macular degeneration, age-related, susceptibility to, 5 (ERCC6)
  • Allelic: Premature ovarian failure 11 (ERCC6)
  • Allelic: XFE progeroid syndrome (ERCC4)
  • Ataxia-telangiectasia-like disorder 1 (MRE11)
  • Cerebrooculofacioskeletal syndrome 1 (ERCC6)
  • Cerebrooculofacioskeletal syndrome 2 (ERCC2)
  • Cerebrooculofacioskeletal syndrome 3 (ERCC5)
  • Cerebrooculofacioskeletal syndrome 4 (ERCC1)
  • Cockayne syndrome, type A (ERCC8)
  • Cockayne syndrome, type B (ERCC6)
  • Microcephaly, developmental delay + brittle hair syndrome (CARS1)
  • Nijmegen breakage syndrome-like severe microcephaly (RAD50)
  • Trichothiodystrophy 1, photosensitive (ERCC2)
  • Trichothiodystrophy 2, photosensitive (ERCC3)
  • Trichothiodystrophy 3, photosensitive (GTF2H5)
  • Trichothiodystrophy 4, nonphotosensitive (MPLKIP)
  • Trichothiodystrophy 5, nonphotosensitive (RNF113A)
  • Trichothiodystrophy 6, nonphotosensitive (GTF2E2)
  • Trichothiodystrophy 7, nonphotosensitive (TARS1)
  • Trichothiodystrophy 8, nonphotosensitive (AARS1)
  • UV-sensitive syndrome 1 (ERCC6)
  • UV-sensitive syndrome 2 (ERCC8)
  • Xeroderma pigmentosum, group A (XPA)
  • Xeroderma pigmentosum, group B (ERCC3)
  • Xeroderma pigmentosum, group C (XPC)
  • Xeroderma pigmentosum, group D (ERCC2)
  • Xeroderma pigmentosum, group E, DDB-negative subtype (DDB2)
  • Xeroderma pigmentosum, group F (ERCC4)
  • Xeroderma pigmentosum, group G (ERCC5)
  • Xeroderma pigmentosum, group G/Cockayne syndrome (ERCC5)
  • Xeroderma pigmentosum, type F/Cockayne syndrome (ERCC4)
  • Xeroderma pigmentosum, variant type (POLH)
Erbgänge, Vererbungsmuster etc.
  • AR
  • XL
OMIM-Ps
  • Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatik und klinische Interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboranforderung

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.