Klinische FragestellungNephrolithiasis, erweitertes panel; Differentialdiagnose
Zusammenfassung
Umfassendes differentialdiagnostisches panel für Nephrolithiasis (erweitertes panel) mit 10 Leitlinien-kuratierten sowie insgesamt 52 kuratierten Genen
90,6 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
- EDTA-Blut (3-5 ml)
NGS +
{Sanger]
Genpanel
Ausgewählte Gene
Name | Exon-Länge (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Erbgang |
---|---|---|---|---|
AGXT | 1179 | NM_000030.3 | AR | |
APRT | 543 | NM_000485.3 | AR | |
ATP6V0A4 | 2523 | NM_020632.3 | AR | |
ATP6V1B1 | 1542 | NM_001692.4 | AR | |
CA2 | 783 | NM_000067.3 | AR | |
CLCN5 | 2241 | NM_000084.5 | XLR | |
CLDN19 | 675 | NM_148960.3 | AR | |
CYP24A1 | 1545 | NM_000782.5 | AR | |
GRHPR | 987 | NM_012203.2 | AR | |
HOGA1 | 984 | NM_138413.4 | AR | |
HPRT1 | 657 | NM_000194.3 | XLR | |
OCRL | 2706 | NM_000276.4 | XLR | |
PHEX | 2250 | NM_000444.6 | XL | |
SLC34A1 | 1920 | NM_003052.5 | AD, AR | |
SLC34A3 | 1800 | NM_080877.2 | AD, AR | |
SLC36A2 | 1452 | NM_181776.3 | AR, AD, digenisch | |
SLC3A1 | 2058 | NM_000341.4 | AD, AR, digenisch | |
SLC4A1 | 2736 | NM_000342.4 | AD, AR | |
XDH | 4002 | NM_000379.4 | AR | |
ADCY10 | 4374 | NM_001167749.3 | AD | |
BSND | 963 | NM_057176.3 | AR | |
CASR | 3237 | NM_000388.4 | AD, AR | |
CFTR | 4443 | NM_000492.4 | AR | |
CLDN16 | 918 | NM_006580.4 | AR | |
CNNM2 | 2628 | NM_017649.5 | AD, AR | |
CYP27B1 | 1527 | NM_000785.4 | AR | |
FAM20A | 1212 | NM_001243746.2 | AR | |
FXYD2 | 201 | NM_001680.5 | AD | |
GNA11 | 1080 | NM_002067.5 | AD | |
HNF4A | 1359 | NM_175914.4 | AD | |
KCNJ1 | 1176 | NM_000220.6 | AR | |
SCNN1A | 2010 | NM_001038.6 | AD, AR | |
SCNN1B | 1923 | NM_000336.3 | AD, AR | |
SCNN1G | 1950 | NM_001039.4 | AD, AR | |
SLC12A1 | 3300 | NM_000338.3 | AR | |
SLC17A3 | 1497 | NM_001098486.2 | AD | |
SLC22A12 | 1560 | NM_001276326.2 | AR | |
SLC26A1 | 2106 | NM_022042.4 | AR | |
SLC2A9 | 1536 | NM_001001290.2 | AR, AD | |
SLC4A4 | 3108 | NM_003759.4 | AR | |
SLC7A9 | 1464 | NM_014270.5 | AD, AR | |
SLC9A3R1 | 1077 | NM_004252.5 | AD | |
STRADA | 1185 | NM_001003786.3 | AR | |
VDR | 1284 | NM_001017535.2 | AD | |
WNK1 | 7149 | NM_018979.4 | AD | |
WNK4 | 3732 | NM_032387.5 | AD |
Infos zur Erkrankung
Eine Nephrolithiasis entwickelt sich bevorzugt vom 40.-60. Lebensjahr, aber Steine können in jedem Alter auftreten; 35-50 % der Stein-Patienten entwickeln später weitere Steine. Obwohl es viele Arten von Nierensteinen gibt, werden vier Haupttypen gemäß ihrer Zusammensetzung unterschieden. Bis zu 75% aller Nierensteine bestehen primär aus Kalzium, z.B. aufgrund von Hyperlkalziurie. Zusätzlich können die Steine aus Harnsäure, Zystin oder Phosphat-Salzen bestehenGenetische Veränderungen können das Risiko für die Entstehung von Nierensteinen erhöhen, oft in Kombination mit einer Reihe von Umwelt- und Lebensstilfaktoren. Die meisten der betreffenden Gene übertragen Zellsignale oder transportieren Stoffe in und aus den Zellen. Veränderungen in diesen Genen können die Menge kritischer Stoffe in den Zellen verändern, was zu einem Ungleichgewicht von Mineralien und Verbindungen im Urin führt. Damit erhöht sich die Wahrscheinlichkeit der Steinbildung. Zu den Dispositionen, die das allgemeine Risiko für Nierensteine erhöhen, gehören Fettleibigkeit, Typ-2-Diabetes, entzündliche Darmerkrankungen, Gicht, Hyperparathyreoidismus, renale tubuläre Azidose und wiederkehrende Harnwegsinfektionen. Insgesamt ist das Risiko, an Nephrolithiasis zu erkranken, bei Personen mit erkrankten Verwandten höher als in der Allgemeinbevölkerung. Die Vererbung von Nierenstein-Erkrankungen ist meist multifaktoriell. In den seltenen Fällen eines mendelnden Erbgangs treten alle klassischen Muster auf. Gen-Panels identifizieren eine ursächliche Variante bei etwa 20% der Nephrolithiasis-Patienten im Kindesalter und weniger als 12-15% im Erwachsenenalter (vor dem 25. Lebensjahren bis fast 30%). Die klinische Diagnose kann niemals durch ein negatives DNA-Testergebnis ausgeschlossen werden.
Referenzen: https://jasn.asnjournals.org/content/28/3/748.short
https://jasn.asnjournals.org/content/jnephrol/26/3/543.full.pdf
- Adenine phosphoribosyltransferase deficiency (APRT)
- Allelic: Amelogenesis imperfecta, type IIA3 (WDR72)
- Arthrogryposis, renal dysfunction + cholestasis 1 (VPS33B)
- Arthrogryposis, renal dysfunction + cholestasis 2 (VIPAS39)
- Cystinuria (SLC3A1, SLC7A9)
- Dent disease 2 (OCRL)
- Dent syndrome (CLCN5)
- Distal renal tubular acidosis 1 (SLC4A1)
- Distal renal tubular acidosis 2 with progressive sensorineural hearing loss (ATP6V1B1)
- Distal renal tubular acidosis 3, with/-out sensorineural hearing loss (ATP6V0A4)
- Distal renal tubular acidosis 4 with hemolytic anemia (SLC4A1)
- Distal renal tubular acidosis [MONDO:0015827] (WDR72)
- Fanconi renotubular syndrome 2 (SLC34A1)
- Hypercalcemia, infantile, 1 (CYP24A1)
- Hypercalcemia, infantile, 2 (SLC34A1)
- Hyperglycinuria (SLC36A2)
- Hyperoxaluria, primary, type I (AGXT)
- Hyperoxaluria, primary, type II (GRHPR)
- Hyperoxaluria, primary, type III (HOGA1)
- Hyperuricemia, HRPT-related (HPRT1)
- Hypomagnesemia 5, renal, with ocular involvement (CLDN19)
- Hypophosphatemic rickets, XLD (PHEX)
- Iminoglycinuria, digenic (SLC36A2)
- Lesch-Nyhan syndrome (HPRT1)
- Nephrolithiasis type 1 (CLCN5)
- Nephrolithiasis/osteoporosis, hypophosphatemic, 1 (SLC34A1)
- Osteopetrosis, AR 3, with renal tubular acidosis (CA2)
- Proteinuria, low molecular weight, with hypercalciuric nephrocalcinosis (CLCN5)
- Xanthinuria, type I (XDH)
- Xanthinuria, type II (MOCOS)
- AD
- AR
- XL
- XLR
- digenisch
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatik und klinische Interpretation
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