Klinische FragestellungZapfen-Stäbchen-Dystrophie/Makuladystrophie, Retinitis pigmentosa; Differentialdiagnose [gr. panel]

Zusammenfassung

Kurzinformation

Umfassendes differentialdiagnostisches panel für Zapfen-Stäbchen-Dystrophie/Makuladystrophie mit 11 "core candidate"-Genen bzw. zusammen genommen 120 kuratierten Genen gemäß klinischer Verdachtsdiagnose

ZP0010

Anzahl Loci

Locus-Typ	Anzahl
Gen	96

Akkreditierte Untersuchung

Untersuchte Sequenzlänge

41,6 kb (Core-/Core-canditate-Gene)
231,5 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)

Analyse-Dauer

auf Anfrage

Untersuchungsmaterial

EDTA-Blut (3-5 ml)

Diagnostische Hinweise

NGS +

Loci

Gen

Name	Exon-Länge (bp)	OMIM-G	Referenz-Seq.	Erbgang
ABCA4	6822	601691	NM_000350.3	AR
BEST1	1758	607854	NM_004183.4	AD, AR
CDHR1	2580	609502	NM_033100.4	AR
CNGA3	2085	600053	NM_001298.3	AR
PDE6C	2577	600827	NM_006204.4	AR
PROM1	2598	604365	NM_006017.3	AD, AR
PRPH2	1041	179605	NM_000322.5	AD, AR, digenisch
RP2	1053	300757	NM_006915.3	XLR
RPE65	1602	180069	NM_000329.3	AD, AR
RPGRIP1	3861	605446	NM_020366.4	AR
USH2A	15609	608400	NM_206933.4	AR
ADAM9	2460	602713	NM_003816.3	AR
AGBL5	2740	615900	NM_001035507.3	AR
AIPL1	1155	604392	NM_014336.5	AD, AR
ARHGEF18	3598	Keine OMIM-Gs verknüpft	NM_001130955.2	AR
ARL2BP	492	615407	NM_012106.4	AR
ARL6	561	608845	NM_177976.3	AR
C1QTNF5	732	608752	NM_015645.5	AD
C2orf71	3869	Keine OMIM-Gs verknüpft	NM_004928.3	AR
CABP4	828	608965	NM_145200.5	AR
CACNA1F	5934	300110	NM_005183.4	XLR
CACNA2D4	3414	608171	NM_172364.5	AR
CDH3	2490	114021	NM_001793.6	AR
CEP290	7440	610142	NM_025114.4	AR
CEP78	2216	617110	NM_001098802.3	AR
CERKL	1677	608381	NM_001030311.3	AR
CFAP410	1507	603191	NM_004928.3	AR
CFAP418	624	614477	NM_177965.4	AR
CFH	3696	134370	NM_000186.4	AD
CLRN1	699	606397	NM_174878.3	AR
CNGA1	2073	123825	NM_000087.5	AD, AR
CNGB1	900	600724	NM_001135639.2	AR
CNGB3	2430	605080	NM_019098.5	AR
CRB1	4221	604210	NM_201253.3	AR
CRX	900	602225	NM_000554.6	AD
CWC27	1883	617170	NM_005869.4	AR
DHDDS	900	608172	NM_001243564.2	AR
EFEMP1	1482	601548	NM_001039348.3	AD
ELOVL4	945	605512	NM_022726.4	AD
EYS	9435	612424	NM_001142800.2	AR
FAM161A	2151	613596	NM_001201543.2	AR
FLVCR1	1668	609144	NM_014053.4	AR
GPR143	1215	300808	NM_000273.3	XL
GUCA1A	606	600364	NM_001384910.1	AD
GUCA1B	603	602275	NM_002098.6	AD
GUCY2D	3312	600179	NM_000180.4	AD, AR
HGSNAT	1908	610453	NM_152419.3	AR
IDH3A	1248	Keine OMIM-Gs verknüpft	NM_005530.3	AR
IDH3B	1158	604526	NM_006899.5	AR
IFT140	4389	614620	NM_014714.4	AR
IMPDH1	1800	146690	NM_000883.4	AD
IMPG2	3726	607056	NM_016247.4	AD, AR
KCNV2	1638	607604	NM_133497.4	AR
KIZ	1712	615757	NM_001163022.3	AR
KLHL7	1761	611119	NM_001031710.3	AD
MAK	1752	154235	NM_001242385.2	AR
MERTK	3000	604705	NM_006343.3	AR
MFSD8	1557	611124	NM_152778.3	AR
NR2E3	1234	604485	NM_014249.4	AD, AR
NRL	714	162080	NM_006177.5	AD, AR
OFD1	3039	300170	NM_003611.3	XL
OTX2	870	600037	NM_172337.3	AD
PCYT1A	1104	123695	NM_005017.4	AR
PDE6A	2583	180071	NM_000440.3	AR
PDE6B	2565	180072	NM_000283.4	AD, AR
PDE6G	264	180073	NM_002602.4	AR
PRCD	165	610598	NM_001077620.3	AR
PRPF3	2052	607301	NM_004698.4	AD
PRPF31	1500	606419	NM_015629.4	AD
PRPF4	1566	607795	NM_001244926.2	AD
PRPF6	2826	613979	NM_012469.4	AD
PRPF8	7008	607300	NM_006445.4	AD
RAB28	663	612994	NM_004249.4	AR
RAX2	555	610362	NM_032753.4	AD
RBP3	3744	180290	NM_002900.3	AR
RBP4	606	180250	NM_006744.4	AD, AR
RCBTB1	1596	607867	NM_018191.4	AD, AR
REEP6	560	609346	NM_138393.4	AR
RGS9	2025	604067	NM_003835.4	AR
RHO	1047	180380	NM_000539.3	AD, AR
RLBP1	954	180090	NM_000326.5	AD, AR
RP1	6471	603937	NM_006269.2	AD, AR
RP1L1	7203	608581	NM_178857.6	AR
RP9	666	607331	NM_203288.2	AD
RPGR	2448	312610	NM_000328.3	XL
SAG	1218	181031	NM_000541.5	AD, AR
SCAPER	4203	611611	NM_020843.4	AR
SEMA4A	2286	607292	NM_022367.4	AR
SNRNP200	6411	601664	NM_014014.5	AD
SPATA7	1704	609868	NM_001040428.4	AR
TIMP3	636	188826	NM_000362.5	AD
TOPORS	3138	609507	NM_005802.5	AD
TTC8	1518	608132	NM_198309.3	AR
TTLL5	3846	612268	NM_015072.5	AR
TULP1	1629	602280	NM_003322.6	AR
UNC119	723	604011	NM_005148.4	AD

Infos zur Erkrankung

Klinischer Kommentar

Vererbte Retina-Dystrophien (RDs) sind eine Gruppe von Erkrankungen, die syndromisch oder nicht-syndromisch auftreten können. Die Sehbehinderung kann von schlechter peripherer oder nächtlicher Sicht bis zur völligen Erblindung reichen, wobei der Schweregrad gewöhnlich mit dem Alter zunimmt. RDs können je nach den betroffenen Photorezeptoren und den Manifestationen bzw. dem Grad der Atrophie innerhalb der Netzhaut in Gruppen eingeteilt werden. Zu den RD-Gruppen gehören Stäbchen-dominierte Erkrankungen, Zapfen-dominierte Erkrankungen und generalisierte Netzhautdegenerationen, an denen sowohl Stäbchen- als auch Zapfen-Photorezeptoren beteiligt sind. Unter den Stäbchen- und Stäbchen-Zapfen-Dystrophien lassen sich progressive degenerative Formen einschließlich Retinitis pigmentosa abgrenzen sowie stationäre Formen, die als kongenitale stationäre Nachtblindheit bezeichnet werden. RDs treten demnach aufgrund von Anomalien der zellulären Strukturen der Netzhaut sowie auch aufgrund von Defekten in der Phototransduktions-Kaskade und der Sehzyklus-Biochemie auf. RD kommt während der gesamten Lebensspanne von der Geburt bis nach dem 60. Lebensjahr vor. Es werden alle klassischen Erbmuster sowie selten digenische Vererbung beobachtet. Teilweise besteht inkomplette Penetranz und oft unterschiedliche klinische Ausprägung. Ein unauffälliger genetischer Befund bedeutet keinen sicheren Ausschluss der klinischen Verdachtsdiagnose, da die diagnostische Ausbeute >50-65% beträgt.

Referenz: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1417/

Synonyme

Alias included: Retinitis pigmentosa
Alias: Cone-rod dystrophy; CORD
Alias: Macular dystrophy
Allelic Senior-Loken syndrome 6 (CEP290)
Allelic: Aland Island eye disease (CACNA1F)
Allelic: Bardet-Biedl syndrome 21 (C8orf37)
Allelic: Basal laminar drusen (CFH)
Allelic: Bestrophinopathy, AR (BEST1)
Allelic: Bradyopsia (RGS9)
Allelic: Bradyopsia (RGS9BP)
Allelic: Cerebellar dysfunction, impaired intellect. develop. + hypogonadotr. hypogonadism (PRDM13)
Allelic: Ceroid lipofuscinosis, neuronal, 7 (MFSD8)
Allelic: Choroidal dystrophy, central areolar 2 (PRPH2)
Allelic: Complement factor B deficiency (CFB)
Allelic: Complement factor H deficiency (CFH)
Allelic: Cutis laxa, AD 2 (FBLN5)
Allelic: Cutis laxa, AR, type IA (FBLN5)
Allelic: Dementia, familial British (ITM2B)
Allelic: Dementia, familial Danish (ITM2B)
Allelic: Fundus flavimaculatus (ABCA4)
Allelic: Hemolytic uremic syndrome, atypical, susceptibility to, 1 (CFH)
Allelic: Hemolytic uremic syndrome, atypical, susceptibility to, 4 (CFB)
Allelic: Ichthyosis, spastic quadriplegia + mental retardation (ELOVL4)
Allelic: Immunodeficiency 13 (UNC119)
Allelic: Joubert syndrome 5 (CEP290)
Allelic: Leber congenital amaurosis 10 (CEP290)
Allelic: Leber congenital amaurosis 18 (PRPH2)
Allelic: Leber congenital amaurosis 4 (AIPL1)
Allelic: Leber congenital amaurosis 6 (RPGRIP1)
Allelic: Leber congenital amaurosis 7 (CRX)
Allelic: Meckel syndrome 4 (CEP290)
Allelic: Microcornea, rod-cone dystrophy, cataract + posterior staphyloma (BEST1)
Allelic: Microphthalmia, isolated, with coloboma 10 (RBP4)
Allelic: Night blindness, congenital stationary (incomplete), 2A, XL (CACNA1F)
Allelic: PERCHING syndrome (KLHL7)
Allelic: Retinitis punctata albescens (PRPH2)
Allelic: Retinoschisis (RS1)
Allelic: Spinocerebellar ataxia 34 (ELOVL4)
Allelic: Spondylometaphyseal dysplasia, axial (CFAP410)
Allelic: Vitreoretinochoroidopathy (BEST1)
Achromatopsia 3 (CNGB3)
Achromatopsia 4 (GNAT2)
Achromatopsia 7 (ATF6)
Achromatopsia, Cone + Cone-rod dystrophy [panelapp] (GNAT2)
Achromatopsia, Cone + Cone-rod dystrophy [panelapp] (RDH5)
Ataxia, posterior column, with retinitis pigmentosa (FLVCR1)
Bardet-Biedl syndrome 14 (CEP290)
Bothnia retinal dystrophy (RLBP1)
Cone dystrophy 3 (GUCA1A)
Cone dystrophy 4 (PDE6C)
Cone dystrophy [MONDO:0000455] (IRX1)
Cone-rod dystrophy (AIPL1)
Cone-rod dystrophy (UNC119)
Cone-rod dystrophy + hearing loss (CEP78)
Cone-rod dystrophy 10 (SEMA4A)
Cone-rod dystrophy 11 (RAX2)
Cone-rod dystrophy 12 (PROM1)
Cone-rod dystrophy 13 (RPGRIP1)
Cone-rod dystrophy 14 (GUCA1A)
Cone-rod dystrophy 15 (CDHR1)
Cone-rod dystrophy 16 (C8orf37 syn. CFAP418)
Cone-rod dystrophy 16 (C8orf37)
Cone-rod dystrophy 18 (RAB28)
Cone-rod dystrophy 19 (TTLL5)
Cone-rod dystrophy 20 (POC1B)
Cone-rod dystrophy 21 (DRAM2)
Cone-rod dystrophy 22 (TLCD3B)
Cone-rod dystrophy 3 (ABCA4)
Cone-rod dystrophy 5 (PITPNM3)
Cone-rod dystrophy 7 (RIMS1)
Cone-rod dystrophy 9 (ADAM9)
Cone-rod dystrophy [panelapp] (GNAT2)
Cone-rod dystrophy and hearing loss 2 (CEP250)
Cone-rod dystrophy, XL, 1 (RPGR)
Cone-rod dystrophy, XL, 3 (CACNA1F)
Cone-rod retinal dystrophy-2 (CRX)
Cone-rod synaptic disorder syndrome, congenital nonprogressive (RIMS2)
Cone-rod synaptic disorder, congenital nonprogressive (CABP4)
Developmental macular + foveal dystrophy [panelapp] (RS1)
Developmental macular + foveal dystrophy; foveal hypoplasia in albinism [panelapp] (GPR143)
Doyne honeycomb degeneration of retina (EFEMP1)
Ectodermal dysplasia, ectrodactyly + macular dystrophy (CDH3)
Fundus albipunctatus (RDH5)
Hypotrichosis, congenital, with juvenile macular dystrophy (CDH3)
Intellectual developmental disorder + retinitis pigmentosa (SCAPER)
Jalili syndrome (CNNM4)
Jalili syndrome [cone-rod dystrophy + amelogenesis imperfecta] (CNNM4)
Joubert syndrome 35 (ARL3)
Leber congenital amaurosis 13 (RDH12)
Macular degeneration, XL atrophic (RPGR)
Macular degeneration, age-related, 1 (HMCN1)
Macular degeneration, age-related, 14, reduced risk of (CFB)
Macular degeneration, age-related, 2 (ABCA4)
Macular degeneration, age-related, 3 (FBLN5)
Macular degeneration, age-related, 4 (CFH)
Macular degeneration, age-related, 6 (RAX2)
Macular degeneration, juvenile (CNGB3)
Macular dystrophy with central cone involvement (MFSD8)
Macular dystrophy, patterned, 1 (PRPH2)
Macular dystrophy, patterned, 2 (CTNNA1)
Macular dystrophy, retinal, 2 (PROM1)
Macular dystrophy, vitelliform, 2 (BEST1)
Macular dystrophy, vitelliform, 3 (PRPH2)
Macular dystrophy, vitelliform, 4 (IMPG1)
Macular dystrophy, vitelliform, 5 (IMPG2)
Macular dystrophy/Degeneration/Stargardt disease [panelapp] (CNGB3)
Macular dystrophy/Degeneration/Stargardt disease [panelapp] (RDH12)
Microcephaly + chorioretinopathy, AR, 1 (TUBGCP6)
Microcephaly + chorioretinopathy, AR, 2 (PLK4)
Microcephaly + chorioretinopathy, AR, 3 (TUBGCP4)
Neuropathy, hereditary, with/-out age-related macular degeneration (FBLN5)
Newfoundland rod-cone dystrophy (RLBP1)
North Carolina macular dystrophy [MONDO:0007630] (PRDM13)
Nystagmus 6, congenital, XL (GPR143)
Occult macular dystrophy (RP1L1)
Ocular albinism, type I, Nettleship-Falls type (GPR143)
Retinal cone dystrophy 3 (PDE6H)
Retinal cone dystrophy 3B (KCNV2)
Retinal cone dystrophy 4 (CACNA2D4)
Retinal degeneration, AR, clumped pigment type (NRL)
Retinal degeneration, late-onset, AD (C1QTNF5)
Retinal dystrophy with inner retinal dysfunction + ganglion cell abnormalities (ITM2B)
Retinal dystrophy with macular staphyloma (C21orf2)
Retinal dystrophy with macular staphyloma (CFAP410)
Retinal dystrophy with/-out extraocular anomalies (RCBTB1)
Retinal dystrophy, early-onset severe (ABCA4)
Retinal dystrophy, early-onset, with/-out pituitary dysfunction (OTX2)
Retinal dystrophy, iris coloboma + comedogenic acne syndrome (RBP4)
Retinitis pigmentosa 1 (RP1)
Retinitis pigmentosa 10 (IMPDH1)
Retinitis pigmentosa 11 (PRPF31)
Retinitis pigmentosa 12 (CRB1)
Retinitis pigmentosa 13 (PRPF8)
Retinitis pigmentosa 14 (TULP1)
Retinitis pigmentosa 18 (PRPF3)
Retinitis pigmentosa 19 (ABCA4)
Retinitis pigmentosa 2 (RP2)
Retinitis pigmentosa 20 (RPE65)
Retinitis pigmentosa 23 (OFD1)
Retinitis pigmentosa 25 (EYS)
Retinitis pigmentosa 26 (CERKL)
Retinitis pigmentosa 27 (NRL)
Retinitis pigmentosa 28 (FAM161A)
Retinitis pigmentosa 3 (RPGR)
Retinitis pigmentosa 31 (TOPORS)
Retinitis pigmentosa 33 (SNRNP200)
Retinitis pigmentosa 35 (SEMA4A)
Retinitis pigmentosa 36 (PRCD)
Retinitis pigmentosa 37 (NR2E3)
Retinitis pigmentosa 38 (MERTK)
Retinitis pigmentosa 4, AD/AR (RHO)
Retinitis pigmentosa 40 (PDE6B)
Retinitis pigmentosa 41 (PROM1)
Retinitis pigmentosa 42 (KLHL7)
Retinitis pigmentosa 43 (PDE6A)
Retinitis pigmentosa 45 (CNGB1)
Retinitis pigmentosa 46 (IDH3B)
Retinitis pigmentosa 47 (SAG)
Retinitis pigmentosa 48 (GUCA1B)
Retinitis pigmentosa 49 (CNGA1)
Retinitis pigmentosa 50 (BEST1)
Retinitis pigmentosa 51 (TTC8)
Retinitis pigmentosa 54 (C2orf71)
Retinitis pigmentosa 55 (ARL6)
Retinitis pigmentosa 56 (IMPG2)
Retinitis pigmentosa 57 (PDE6G)
Retinitis pigmentosa 59 (DHDDS)
Retinitis pigmentosa 60 (PRPF6)
Retinitis pigmentosa 61 (CLRN1)
Retinitis pigmentosa 62 (MAK)
Retinitis pigmentosa 64 (C8orf37 syn. CFAP418)
Retinitis pigmentosa 64 (C8orf37)
Retinitis pigmentosa 65 (CDHR1)
Retinitis pigmentosa 66 (RBP3)
Retinitis pigmentosa 69 (KIZ)
Retinitis pigmentosa 7 + digenic form (PRPH2)
Retinitis pigmentosa 70 (PRPF4)
Retinitis pigmentosa 73 (HGSNAT)
Retinitis pigmentosa 75 (AGBL5)
Retinitis pigmentosa 77 (REEP6)
Retinitis pigmentosa 78 (ARHGEF18)
Retinitis pigmentosa 80 (IFT140)
Retinitis pigmentosa 83 (ARL3)
Retinitis pigmentosa 87 with choroidal involvement (RPE65)
Retinitis pigmentosa 88 (RP1L1)
Retinitis pigmentosa 9 (RP9)
Retinitis pigmentosa 90 (IDH3A)
Retinitis pigmentosa 91 (IMPG1)
Retinitis pigmentosa [panelapp] (RDH12)
Retinitis pigmentosa with/-out situs inversus (ARL2BP)
Retinitis pigmentosa with/-out skeletal anomalies (CWC27)
Retinitis pigmentosa, XL + sinorespiratory infections, with/-out deafness (RPGR)
Retinitis pigmentosa, concentric (BEST1)
Retinitis pigmentosa, juvenile (AIPL1)
Retinitis pigmentosa, juvenile, AR (SPATA7)
Sorsby fundus dystrophy (TIMP3)
Spondylometaphyseal dysplasia with cone-rod dystrophy (PCYT1A)
Stargardt disease 1 (ABCA4)
Stargardt disease 3 (ELOVL4)
Stargardt disease 4 (PROM1)

Erbgänge, Vererbungsmuster etc.

AD
AR
XL
XLR
digenisch

OMIM-Ps

Multiple OMIM-Ps

ICD10 Code

Bioinformatik und klinische Interpretation

Test-Stärken

DAkkS-akkreditiertes Labor
EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
Gen-Konversionen
komplexe Inversionen
Balancierte Translokationen
Mitochondriale Varianten
Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
niedriger Mosaik-Status
Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
Varianten innerhalb von Pseudogenen
die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboranforderung

Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.