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Klinische FragestellungÜberwachstum, segmentales - PIK3CA; Differentialdiagnose

Zusammenfassung

Kurzinformation

Umfassendes differentialdiagnostisches panel für Überwachstum, segmentales mit 1 "core"-Gen [PIK3CA], 9 "core candidate"-Genen bzw. zusammen genommen 15 kuratierten Genen gemäß klinischer Verdachtsdiagnose

ID
SP9375
Anzahl Gene
12 Akkreditierte Untersuchung
Untersuchte Sequenzlänge
24,4 kb (Core-/Core-canditate-Gene)
29,0 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
Analyse-Dauer
auf Anfrage
Material
  • EDTA-Blut (3-5 ml)
Diagnostische Hinweise

NGS +

[Sanger]

 

Genpanel

Ausgewählte Gene

NameExon-Länge (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Erbgang
AKT11443NM_005163.2AD
AKT31440NM_005465.7AD
CCND2870NM_001759.4AD
CDKN1C951NM_000076.2AD
MTOR7650NM_004958.4AD
PIK3CA3207NM_006218.4AD
PIK3R22187NM_005027.4AD
PTEN1212NM_000314.8AD
RASA13144NM_002890.3AD
SUZ122220NM_015355.4AD
AKT21446NM_001626.6AD
NLRP23189NM_017852.5AD, AR

Infos zur Erkrankung

Klinischer Kommentar

The PIK3CA-related overgrowth spectrum (PROS) includes a number of clinical findings whose main features are congenital or early childhood segmental/focal overgrowth with or without cellular dysplasia. These include hemi-megalencephaly, fibroadipose hyperplasia and congenital lipomatous overgrowth, vascular malformations, epidermal nevi, and skeletal or spinal anomalies (CLOVES syndrome). The syndrome includes overgrowth of adipose tissue in the abdomen, often with a reddish mole on the skin, and abnormalities of the blood vessels, skin, and bones. As in Klippel-Trenaunay syndrome, megalencephaly-capillary abscess formation (MCAP), and epidermal nevus, PIK3CA mutations occur somatically as a mosaic. Proteus syndrome, which is important in differential diagnosis, is a rare disorder with usually asymmetric overgrowth of bone, skin, and other tissues. Newborns with Proteus syndrome rarely have symptoms. The overgrowth becomes evident at 6-18 months of age and continues to increase with age. The pattern of overgrowth varies widely, but can affect almost any part of the body. The bones of the limbs, skull and spine are often affected. The disease can also cause a variety of skin growths, especially cerebriform connective tissue nevi. Vascular and adipose tissue may also grow excessively in Proteus syndrome. Patients with Proteus syndrome may have neurological abnormalities, including mental retardation, seizures, and visual disturbances, as well as prominent facial features and various benign tumors and deep vein thrombosis. Proteus syndrome results from AKT1 somatic mutations. Mutations in the PTEN gene do not result in Proteus syndrome; instead, patients suffer from PTEN hamartoma tumor syndrome with segmental overgrowth, lipomatosis, arteriovenous malformations, and epidermal nevi (SOLAMEN syndrome or segmental Cowden syndrome type 2). The complex differential diagnosis for the above and similar disorders includes a number of additional genes. The molecular genetic diagnostic yield of this comprehensive gene panel is unknown; it depends largely on the quality of the patient's clinical workup. Therefore, a negative DNA test result may not exclude the clinical diagnosis.

References: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK153722/

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK99495/

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK396098/

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1488/

 

Synonyme
  • Alias: PIK3CA-related overgrowth syndrome
  • Allelic: Basal cell carcinoma, somatic (RASA1)
  • Allelic: Breast cancer, somatic (AKT1, PIK3CA)
  • Allelic: CLAPO syndrome, somatic (PIK3CA)
  • Allelic: CLOVE syndrome, somatic (PIK3CA)
  • Allelic: Colorectal cancer, somatic (AKT1, PIK3CA)
  • Allelic: Cowden syndrome 1 [Bannayan-Riley-Ruvalcaba] (PTEN)
  • Allelic: Cowden syndrome 5 (PIK3CA)
  • Allelic: Cowden syndrome 6 (AKT1)
  • Allelic: Diabetes mellitus, type II (AKT2)
  • Allelic: Focal cortical dysplasia, type II, somatic (MTOR)
  • Allelic: Gastric cancer, somatic (PIK3CA)
  • Allelic: Hepatocellular carcinoma, somatic (PIK3CA)
  • Allelic: Keratosis, seborrheic, somatic (PIK3CA)
  • Allelic: Lhermitte-Duclos syndrome (PTEN)
  • Allelic: Macrodactyly, somatic (PIK3CA)
  • Allelic: Nevus, epidermal, somatic (PIK3CA)
  • Allelic: Nonsmall cell lung cancer, somatic (PIK3CA)
  • Allelic: Ovarian cancer, somatic (AKT1, PIK3CA)
  • Beckwith-Wiedemann syndrome [MONDO:0016475] (NLRP2)
  • Beckwith-Wiedemann syndrome [panelapp] (PADI6)
  • Capillary malformation-arteriovenous malformation 1 (RASA1)
  • Central conducting lymphatic anomaly [panelapp] (ARAF)
  • Cutaneous and hepatic vascular lesions [panelapp] (GJA4)
  • Hypoinsulinemic hypoglycemia with hemihypertrophy (AKT2)
  • Macrocephaly/autism syndrome (PTEN)
  • Megalencephaly-capillary malformation-polymicrogyria syndrome, somatic (PIK3CA)
  • Megalencephaly-polymicrogyria-polydactyly-hydrocephalus syndrome 1 (PIK3R1)
  • Megalencephaly-polymicrogyria-polydactyly-hydrocephalus syndrome 2 (AKT3)
  • Megalencephaly-polymicrogyria-polydactyly-hydrocephalus syndrome 3 (CCND2)
  • Preimplantation embryonic lethality 2 (PADI6)
  • Proteus syndrome, somatic (AKT1)
  • Smith-Kingsmore syndrome (MTOR)
Erbgänge, Vererbungsmuster etc.
  • AD
  • AR
OMIM-Ps
  • Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatik und klinische Interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboranforderung

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.