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Klinische FragestellungLymphödem, kongenitales erbliches; Differentialdiagnose

Zusammenfassung

Kurzinformation

Umfassendes differentialdiagnostisches panel für kongenitales erbliches Lymphödem mit 9 Leitlinien-kuratierten bzw. zusammen genommen 45 kuratierten Genen gemäß klinischer Verdachtsdiagnose

ID
LP5200
Anzahl Loci
Locus-TypAnzahl
Gen 40
Akkreditierte Untersuchung
Untersuchte Sequenzlänge
29,3 kb (Core-/Core-canditate-Gene)
139,2 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
Analyse-Dauer
auf Anfrage
Untersuchungsmaterial
  • EDTA-Blut (3-5 ml)
Diagnostische Hinweise

NGS +

[Sanger]

 

Loci

Gen

NameExon-Länge (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Erbgang
CCBE11221NM_133459.4AR
EPHB42964NM_004444.5AD
FLT44092NM_182925.5AD
FOXC21506NM_005251.3AD
GATA21443NM_032638.5AD
GJC21320NM_020435.4AD
KIF113171NM_004523.4AD
PIEZO17566NM_001142864.4AD
PTPN143564NM_005401.5AR
SOX181155NM_018419.3AD, AR
VEGFC1263NM_005429.5AD
ADAMTS33653NM_014243.3AR
BRAF2301NM_004333.6AD
CBL2721NM_005188.4AD
CELSR19045NM_014246.4AD
CHD78994NM_017780.4AD
DCHS19897NM_003737.4AR
FAT414946NM_024582.6AR
GJA11149NM_000165.5AD
HRAS570NM_005343.4AD
KRAS567NM_004985.5AD
LZTR12523NM_006767.4AD, AR
MAP2K11182NM_002755.4AD
MAP2K21203NM_030662.4AD
NF18457NM_001042492.3AD
NRAS570NM_002524.5SMu
NSD18091NM_022455.5AD
PMM2741NM_000303.3AR
PPP1CB350NM_002709.3AD
PTPN111782NM_002834.5AD
RAF11947NM_002880.4AD
RASA13144NM_002890.3AD
RIT1660NM_006912.6AD
SHANK35386NM_001372044.2AD
SHOC21749NM_007373.4AD
SOS14002NM_005633.4AD
SOS23999NM_006939.4AD
SPRED11335NM_152594.3AD
TSC13495NM_000368.5AD
TSC25424NM_000548.5AD

Infos zur Erkrankung

Klinischer Kommentar

Das primäre Lymphödem (PL) ist eine genetisch bedingte Erkrankung des Lymphgefässsystems und führt zu Schwellungen einer oder mehrerer Extremitäten. Der Zeitpunkt des Auftretens, das klinische Bild und der Schweregrad sind heterogen und variieren je nach Genveränderung. Da syndromale Formen bekannt sind, ist eine genetische Diagnostik essentiell. Um einer Progression möglichst entgegenzuwirken, ist eine zeitgerechte Therapieeinleitung wichtig. Die häufigste Form des angeborenen Lymphödems ist die Milroy-Erkrankung, bedingt durch eine heterozygote Mutation im VEGFR-3 Gen. Typischerweise ist das Lymphödem bilateral am Fussrücken und unterhalb der Knie, männliche Betroffene zeigen eine Hydrozele. Da der betroffene Rezeptor auch in der Angiogenese der Venen beteiligt ist, kommt es im frühen Erwachsenenalter nicht selten zu einer Varikosis. Eine weitere klinisch besonders relevante Form ist das Emberger Syndrom (bedingt durch pathogene Varianten des GATA2-Gens), die neben dem Lymphödem mit einer sensineuralen Schwerhörigkeit sowie einer zellvermittelten Immundefizienz einhergeht.

Literatur: https://www.paediatrieschweiz.ch/primaeres-lymphoedem-im-kindesalter/

 

Synonyme
  • Alias: Early-onset primary congenital lymphedema
  • Allelic: Congenital heart defects, multiple types, 7 (FLT4)
  • Allelic: Fibromatosis, gingival, 1 (SOS1)
  • Allelic: Hemangioma, capillary infantile, somatic (FLT4)
  • Allelic: Hypogonadotropic hypogonadism 5 with/-out anosmia (CHD7)
  • Allelic: Juvenile myelomonocytic leukemia (CBL)
  • Allelic: Leukemia, juvenile myelomonocytic (NF1)
  • Allelic: Leukodystrophy, hypomyelinating, 2 (GJC2)
  • Allelic: Mitral valve prolapse 2 (DCHS1)
  • Allelic: Neurofibromatosis, familial spinal (NF1)
  • Allelic: Schwannomatosis-2, susceptibility to (LZTR1)
  • Allelic: Spastic paraplegia 44, AR (GJC2)
  • CHARGE [Coloboma, Heart anomalies, choanal Atresia, mR, Genital + Ear anomalies] syndrome (CHD7)
  • Capillary malformation-arteriovenous malformation 1 (RASA1)
  • Capillary malformation-arteriovenous malformation 2 (EPHB4)
  • Cardiofaciocutaneous syndrome (BRAF)
  • Cardiofaciocutaneous syndrome 2 (KRAS)
  • Cardiofaciocutaneous syndrome 3 (MAP2K1)
  • Cardiomyopathy, dilated, 1NN (RAF1)
  • Choanal atresia + lymphedema (PTPN14)
  • Congenital disorder of glycosylation, type Ia (PMM2)
  • Congenital myopathy with excess muscle spindles (HRAS)
  • Costello syndrome (HRAS)
  • Ectodermal dysplasia + immunodeficiency 1 (IKBKG)
  • Emberger syndrome [Lymphedema, primary, with Mmyelodysplasia] (GATA2)
  • Hennekam lymphangiectasia-lymphedema syndrome 1 (CCBE1)
  • Hennekam lymphangiectasia-lymphedema syndrome 2 (FAT4)
  • Hennekam lymphangiectasia-lymphedema syndrome 3 (ADAMTS3)
  • Hypotrichosis-lymphedema-telangiectasia syndrome (SOX18)
  • Hypotrichosis-lymphedema-telangiectasia-renal defect syndrome (SOX18)
  • Immunodeficiency 33 (IKBKG)
  • Immunodeficiency 42 (RORC)
  • Incontinentia pigmenti (IKBKKG)
  • LEOPARD syndrome 1 (PTPN11)
  • LEOPARD syndrome 2 (RAF1)
  • LEOPARD syndrome 3 (BRAF)
  • Legius syndrome (SPREAD1)
  • Lymphangioleiomyomatosis (TSC1)
  • Lymphangioleiomyomatosis, somatic (TSC2)
  • Lymphatic malformation 10 (ANGPT2)
  • Lymphatic malformation 11 (TIE1)
  • Lymphatic malformation 1; [Nonne-Milroy lymphedema] (FLT4)
  • Lymphatic malformation 3 (GJC2)
  • Lymphatic malformation 4 (VEGFC)
  • Lymphatic malformation 6 (PIEZO1)
  • Lymphatic malformation 7 (EPHB4)
  • Lymphatic malformation 9 (CELSR1)
  • Lymphedema-distichiasis syndrome (FOXC2)
  • Lymphedema-distichiasis syndrome with renal disease and diabetes mellitus (FOXC2)
  • Lymphoedema [MONDO:0019297] (ARAP3)
  • Lymphoedema [MONDO:0019297] (RORC)
  • Metachondromatosis 1 (PTPN11)
  • Microcephaly with or without chorioretinopathy, lymphedema, or mental retardation (KIF11)
  • Neurofibromatosis, type 1 (NF1)
  • Neurofibromatosis-Noonan syndrome (NF1)
  • Noonan syndrome 1 (PTPN11)
  • Noonan syndrome 10 (LZTR1)
  • Noonan syndrome 2 (LZTR1)
  • Noonan syndrome 3 (KRAS)
  • Noonan syndrome 4 (SOS1)
  • Noonan syndrome 5 (RAF1)
  • Noonan syndrome 6 (NRAS)
  • Noonan syndrome 7 (BRAF)
  • Noonan syndrome 8 (RIT1)
  • Noonan syndrome 9 (SOS2)
  • Noonan syndrome-like disorder with loose anagen hair 2 (PPP1CB)
  • Noonan syndrome-like disorder with/-out juvenile myelomonocytic leukemia (CBL)
  • Noonan syndrome-like with loose anagen hair 1 (SHOC2)
  • Phelan-McDermid syndrome (SHANK3)
  • RAS-associated autoimmune leukoproliferative disorder (KRAS)
  • Schizophrenia 15 (SHANK3)
  • Sotos syndrome 1 (NSD1)
  • Van Maldergem syndrome 1 (DCHS1)
  • Van Maldergem syndrome 2 (FAT4)
  • Watson syndrome (NF1)
  • ardiofaciocutaneous syndrome 4 (MAP2K2)
Erbgänge, Vererbungsmuster etc.
  • AD
  • AR
  • SMu
OMIM-Ps
  • Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatik und klinische Interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboranforderung

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.