Klinische FragestellungLymphödem, kongenitales erbliches; Differentialdiagnose
Zusammenfassung
Umfassendes differentialdiagnostisches panel für kongenitales erbliches Lymphödem mit 9 Leitlinien-kuratierten bzw. zusammen genommen 45 kuratierten Genen gemäß klinischer Verdachtsdiagnose
| Locus-Typ | Anzahl |
|---|---|
| Gen | 40 |
139,2 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
- EDTA-Blut (3-5 ml)
NGS +
[Sanger]
Loci
Gen
| Name | Exon-Länge (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Erbgang |
|---|---|---|---|---|
| CCBE1 | 1221 | NM_133459.4 | AR | |
| EPHB4 | 2964 | NM_004444.5 | AD | |
| FLT4 | 4092 | NM_182925.5 | AD | |
| FOXC2 | 1506 | NM_005251.3 | AD | |
| GATA2 | 1443 | NM_032638.5 | AD | |
| GJC2 | 1320 | NM_020435.4 | AD | |
| KIF11 | 3171 | NM_004523.4 | AD | |
| PIEZO1 | 7566 | NM_001142864.4 | AD | |
| PTPN14 | 3564 | NM_005401.5 | AR | |
| SOX18 | 1155 | NM_018419.3 | AD, AR | |
| VEGFC | 1263 | NM_005429.5 | AD | |
| ADAMTS3 | 3653 | NM_014243.3 | AR | |
| BRAF | 2301 | NM_004333.6 | AD | |
| CBL | 2721 | NM_005188.4 | AD | |
| CELSR1 | 9045 | NM_014246.4 | AD | |
| CHD7 | 8994 | NM_017780.4 | AD | |
| DCHS1 | 9897 | NM_003737.4 | AR | |
| FAT4 | 14946 | NM_024582.6 | AR | |
| GJA1 | 1149 | NM_000165.5 | AD | |
| HRAS | 570 | NM_005343.4 | AD | |
| KRAS | 567 | NM_004985.5 | AD | |
| LZTR1 | 2523 | NM_006767.4 | AD, AR | |
| MAP2K1 | 1182 | NM_002755.4 | AD | |
| MAP2K2 | 1203 | NM_030662.4 | AD | |
| NF1 | 8457 | NM_001042492.3 | AD | |
| NRAS | 570 | NM_002524.5 | SMu | |
| NSD1 | 8091 | NM_022455.5 | AD | |
| PMM2 | 741 | NM_000303.3 | AR | |
| PPP1CB | 350 | NM_002709.3 | AD | |
| PTPN11 | 1782 | NM_002834.5 | AD | |
| RAF1 | 1947 | NM_002880.4 | AD | |
| RASA1 | 3144 | NM_002890.3 | AD | |
| RIT1 | 660 | NM_006912.6 | AD | |
| SHANK3 | 5386 | NM_001372044.2 | AD | |
| SHOC2 | 1749 | NM_007373.4 | AD | |
| SOS1 | 4002 | NM_005633.4 | AD | |
| SOS2 | 3999 | NM_006939.4 | AD | |
| SPRED1 | 1335 | NM_152594.3 | AD | |
| TSC1 | 3495 | NM_000368.5 | AD | |
| TSC2 | 5424 | NM_000548.5 | AD |
Infos zur Erkrankung
Das primäre Lymphödem (PL) ist eine genetisch bedingte Erkrankung des Lymphgefässsystems und führt zu Schwellungen einer oder mehrerer Extremitäten. Der Zeitpunkt des Auftretens, das klinische Bild und der Schweregrad sind heterogen und variieren je nach Genveränderung. Da syndromale Formen bekannt sind, ist eine genetische Diagnostik essentiell. Um einer Progression möglichst entgegenzuwirken, ist eine zeitgerechte Therapieeinleitung wichtig. Die häufigste Form des angeborenen Lymphödems ist die Milroy-Erkrankung, bedingt durch eine heterozygote Mutation im VEGFR-3 Gen. Typischerweise ist das Lymphödem bilateral am Fussrücken und unterhalb der Knie, männliche Betroffene zeigen eine Hydrozele. Da der betroffene Rezeptor auch in der Angiogenese der Venen beteiligt ist, kommt es im frühen Erwachsenenalter nicht selten zu einer Varikosis. Eine weitere klinisch besonders relevante Form ist das Emberger Syndrom (bedingt durch pathogene Varianten des GATA2-Gens), die neben dem Lymphödem mit einer sensineuralen Schwerhörigkeit sowie einer zellvermittelten Immundefizienz einhergeht.
Literatur: https://www.paediatrieschweiz.ch/primaeres-lymphoedem-im-kindesalter/
- Alias: Early-onset primary congenital lymphedema
- Allelic: Congenital heart defects, multiple types, 7 (FLT4)
- Allelic: Fibromatosis, gingival, 1 (SOS1)
- Allelic: Hemangioma, capillary infantile, somatic (FLT4)
- Allelic: Hypogonadotropic hypogonadism 5 with/-out anosmia (CHD7)
- Allelic: Juvenile myelomonocytic leukemia (CBL)
- Allelic: Leukemia, juvenile myelomonocytic (NF1)
- Allelic: Leukodystrophy, hypomyelinating, 2 (GJC2)
- Allelic: Mitral valve prolapse 2 (DCHS1)
- Allelic: Neurofibromatosis, familial spinal (NF1)
- Allelic: Schwannomatosis-2, susceptibility to (LZTR1)
- Allelic: Spastic paraplegia 44, AR (GJC2)
- CHARGE [Coloboma, Heart anomalies, choanal Atresia, mR, Genital + Ear anomalies] syndrome (CHD7)
- Capillary malformation-arteriovenous malformation 1 (RASA1)
- Capillary malformation-arteriovenous malformation 2 (EPHB4)
- Cardiofaciocutaneous syndrome (BRAF)
- Cardiofaciocutaneous syndrome 2 (KRAS)
- Cardiofaciocutaneous syndrome 3 (MAP2K1)
- Cardiomyopathy, dilated, 1NN (RAF1)
- Choanal atresia + lymphedema (PTPN14)
- Congenital disorder of glycosylation, type Ia (PMM2)
- Congenital myopathy with excess muscle spindles (HRAS)
- Costello syndrome (HRAS)
- Ectodermal dysplasia + immunodeficiency 1 (IKBKG)
- Emberger syndrome [Lymphedema, primary, with Mmyelodysplasia] (GATA2)
- Hennekam lymphangiectasia-lymphedema syndrome 1 (CCBE1)
- Hennekam lymphangiectasia-lymphedema syndrome 2 (FAT4)
- Hennekam lymphangiectasia-lymphedema syndrome 3 (ADAMTS3)
- Hypotrichosis-lymphedema-telangiectasia syndrome (SOX18)
- Hypotrichosis-lymphedema-telangiectasia-renal defect syndrome (SOX18)
- Immunodeficiency 33 (IKBKG)
- Immunodeficiency 42 (RORC)
- Incontinentia pigmenti (IKBKKG)
- LEOPARD syndrome 1 (PTPN11)
- LEOPARD syndrome 2 (RAF1)
- LEOPARD syndrome 3 (BRAF)
- Legius syndrome (SPREAD1)
- Lymphangioleiomyomatosis (TSC1)
- Lymphangioleiomyomatosis, somatic (TSC2)
- Lymphatic malformation 10 (ANGPT2)
- Lymphatic malformation 11 (TIE1)
- Lymphatic malformation 1; [Nonne-Milroy lymphedema] (FLT4)
- Lymphatic malformation 3 (GJC2)
- Lymphatic malformation 4 (VEGFC)
- Lymphatic malformation 6 (PIEZO1)
- Lymphatic malformation 7 (EPHB4)
- Lymphatic malformation 9 (CELSR1)
- Lymphedema-distichiasis syndrome (FOXC2)
- Lymphedema-distichiasis syndrome with renal disease and diabetes mellitus (FOXC2)
- Lymphoedema [MONDO:0019297] (ARAP3)
- Lymphoedema [MONDO:0019297] (RORC)
- Metachondromatosis 1 (PTPN11)
- Microcephaly with or without chorioretinopathy, lymphedema, or mental retardation (KIF11)
- Neurofibromatosis, type 1 (NF1)
- Neurofibromatosis-Noonan syndrome (NF1)
- Noonan syndrome 1 (PTPN11)
- Noonan syndrome 10 (LZTR1)
- Noonan syndrome 2 (LZTR1)
- Noonan syndrome 3 (KRAS)
- Noonan syndrome 4 (SOS1)
- Noonan syndrome 5 (RAF1)
- Noonan syndrome 6 (NRAS)
- Noonan syndrome 7 (BRAF)
- Noonan syndrome 8 (RIT1)
- Noonan syndrome 9 (SOS2)
- Noonan syndrome-like disorder with loose anagen hair 2 (PPP1CB)
- Noonan syndrome-like disorder with/-out juvenile myelomonocytic leukemia (CBL)
- Noonan syndrome-like with loose anagen hair 1 (SHOC2)
- Phelan-McDermid syndrome (SHANK3)
- RAS-associated autoimmune leukoproliferative disorder (KRAS)
- Schizophrenia 15 (SHANK3)
- Sotos syndrome 1 (NSD1)
- Van Maldergem syndrome 1 (DCHS1)
- Van Maldergem syndrome 2 (FAT4)
- Watson syndrome (NF1)
- ardiofaciocutaneous syndrome 4 (MAP2K2)
- AD
- AR
- SMu
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatik und klinische Interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboranforderung
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.