Klinische FragestellungKolorektale Karzinome, erbliche; Differentialdiagnose
Zusammenfassung
Umfassendes differentialdiagnostisches panel für Erbliche kolorektale Karzinome mit 11/13 Leitlinien-kuratierten Genen bzw. insgesamt 23 kuratierten Genen gemäß klinischer Verdachtsdiagnose
63,3 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
- EDTA-Blut (3-5 ml)
NGS +
[Sanger]
Genpanel
Ausgewählte Gene
Name | Exon-Länge (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Erbgang |
---|---|---|---|---|
APC | 8532 | NM_000038.6 | AD | |
BMPR1A | 1599 | NM_004329.3 | AD | |
EPCAM | 945 | NM_002354.3 | AD | |
MLH1 | 2271 | NM_000249.4 | AD | |
MSH2 | 2805 | NM_000251.3 | AD | |
MSH6 | 4083 | NM_000179.3 | AD | |
MUTYH | 1650 | NM_001128425.2 | AR | |
NTHL1 | 915 | NM_002528.7 | AR | |
PMS2 | 2589 | NM_000535.7 | AD | |
POLD1 | 3324 | NM_002691.4 | AD | |
POLE | 6861 | NM_006231.4 | AD | |
PTEN | 1212 | NM_000314.8 | AD | |
SMAD4 | 1659 | NM_005359.6 | AD | |
STK11 | 1302 | NM_000455.5 | AD | |
AXIN2 | 2532 | NM_004655.4 | AD | |
CDH1 | 2649 | NM_004360.5 | AD | |
CHEK2 | 1632 | NM_007194.4 | AD | |
GREM1 | 555 | NM_013372.7 | AD | |
MLH3 | 4362 | NM_001040108.2 | AD | |
MSH3 | 3414 | NM_002439.5 | AR | |
RNF43 | 5500 | NM_017763.6 | AD | |
TGFBR2 | 1704 | NM_003242.6 | AD | |
TP53 | 1182 | NM_000546.6 | AD |
Infos zur Erkrankung
Das kolorektale Karzinom (CRC) ist als Volkskrankheit der 3.-häufigste Krebs bei Männern und der 2.-häufigste bei Frauen. Das hereditäre CRC hat zwei gut bekannte Formen: [A] Polyposis einschließlich der familiären adenomatösen Polyposis (FAP) und der abgeschwächten FAP, verursacht durch pathogene Varianten im APC-Gen, MUTYH-assoziierte Polyposis, verursacht durch pathogene Varianten im MUTYH-Gen; [B] Lynch-Syndrom - oft als hereditäres nicht polypöses CRC bezeichnet - verursacht durch pathogene Keimbahnvarianten in den DNA-"Mismatch-Reparatur"-Genen (MLH1-, MSH2-, MSH6-, PMS2-Gene) und EPCAM-Gen. Weitere CRC-Syndrome und deren assoziierte Gene sind Oligopolyposis (POLE-, POLD1-Gene), NTHL1, juveniles Polyposis-Syndrom (BMPR1A-, SMAD4-Gene), Cowden (PTEN-Gen) und Peutz-Jeghers Syndrom (STK11-Gen). Viele der aufgeführten Syndrome sind auch mit extra-kolonischen Karzinomen und anderen Manifestationen assoziiert. Das Serratierte-Polyposis-Syndrom ist durch hyperplastische Polypen gekennzeichnet. Zumindest in einigen Fällen hat es auch familiäre Komponenten. Ungefähr ein Viertel der CRC- und/oder Adenom-Fälle scheint familiär bedingt zu sein, aber nur ein Teil davon basierend auf einem identifizierbaren erblichen Syndrom. Die meisten Personen mit CRC, die vor dem 50. Lebensjahr diagnostiziert werden und keine familiäre Krebsvorgeschichte haben, weisen keine pathogenen Varianten auf, die mit einem erblichen Krebssyndrom assoziiert sind. Die DNA-diagnostische Ausbeute wird mit bis über 90% angegeben. Dennoch stellt ein negatives molekulargenetisches Ergebnis keinen absolut sicheren Ausschluss der klinischen Diagnose dar.
Referenzen: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1211/
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1345/
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1469/
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1266/
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1488/
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK107219/
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK555473/
- Alias: Colon-Ca
- Alias: Darmkrebs
- Alias: Kolorektalkarzinom
- Alias: Rektum-Ca
- Allelic: Adenoma, periampullary, somatic (APC)
- Allelic: Adrenocortical carcinoma, pediatric (TP53)
- Allelic: Aplastic anemia (NBN)
- Allelic: Basal cell carcinoma 7 (TP53)
- Allelic: Birt-Hogg-Dube syndrome (FLCN)
- Allelic: Blepharocheilodontic syndrome 1 (CDH1)
- Allelic: Bone marrow failure syndrome 5 (TP53)
- Allelic: Brain tumor-polyposis syndrome 2 (APC)
- Allelic: Breast cancer, lobular (CDH1)
- Allelic: Breast cancer, somatic (TP53)
- Allelic: Breast cancer, susceptibility to (CHEK2)
- Allelic: Choroid plexus papilloma (TP53)
- Allelic: Desmoid disease, hereditary (APC)
- Allelic: Diarrhea 5, with tufting enteropathy, congenital (EPCAM)
- Allelic: Endometrial cancer, familial (MSH6)
- Allelic: Endometrial carcinoma, somatic (CDH1)
- Allelic: Endometrial carcinoma, somatic (MSH3)
- Allelic: Esophageal cancer, somatic (TGFBR2)
- Allelic: FILS syndrome (POLE)
- Allelic: Gastric cancer, hereditary diffuse, with/-out cleft lip and/or palate (CDH1)
- Allelic: Gastric cancer, somatic (APC)
- Allelic: Gastric cancer, somatic (MUTYH)
- Allelic: Glioma susceptibility 1 (TP53)
- Allelic: Hepatoblastoma, somatic (APC)
- Allelic: Hepatocellular carcinoma, somatic (TP53)
- Allelic: IMAGE-I syndrome (POLE)
- Allelic: Juvenile polyposis/hereditary hemorrhagic telangiectasia syndrome (SMAD4)
- Allelic: Leukemia, acute lymphoblastic (NBN)
- Allelic: Li-Fraumeni syndrome (CHEK2)
- Allelic: Li-Fraumeni syndrome (TP53)
- Allelic: Loeys-Dietz syndrome 2 (TGFBR2)
- Allelic: Mandibular hypoplasia, deafness, progeroid features, and lipodystrophy syndrome (POLD1)
- Allelic: Melanoma, malignant, somatic (STK11)
- Allelic: Mismatch repair cancer syndrome (MLH1, MSH2, MSH6, PMS2)
- Allelic: Muir-Torre syndrome (MLH1, MSH2)
- Allelic: Myhre syndrome (SMAD4)
- Allelic: Nasopharyngeal carcinoma, somatic (TP53)
- Allelic: Nijmegen breakage syndrome (NBN)
- Allelic: Oligodontia-colorectal cancer syndrome (AXIN2)
- Allelic: Osteosarcoma (TP53)
- Allelic: Osteosarcoma, somatic (CHEK2)
- Allelic: Ovarian cancer, somatic (CDH1)
- Allelic: Pancreatic cancer, somatic (SMAD4)
- Allelic: Pancreatic cancer, somatic (STK11)
- Allelic: Pancreatic cancer, somatic (TP53)
- Allelic: Pneumothorax, primary spontaneous (FLCN)
- Allelic: Prostate cancer, familial, susceptibility to (CHEK2)
- Allelic: Prostate cancer, susceptibility to (CDH1)
- Allelic: Renal carcinoma, chromophobe, somatic (FLCN)
- Allelic: Testicular tumor, somatic (STK11)
- Adenomas, multiple colorectal (MUTYH)
- Adenomatous polyposis coli (APC)
- Breast and colorectal cancer, susceptibility to (CHEK2)
- Colorectal cancer (TP53)
- Colorectal cancer, hereditary nonpolyposis, type 1 (MSH2)
- Colorectal cancer, hereditary nonpolyposis, type 2 (MLH1)
- Colorectal cancer, hereditary nonpolyposis, type 4 (PMS2)
- Colorectal cancer, hereditary nonpolyposis, type 5 (MSH6)
- Colorectal cancer, hereditary nonpolyposis, type 6 (TGFBR2)
- Colorectal cancer, hereditary nonpolyposis, type 7 (MLH3)
- Colorectal cancer, hereditary nonpolyposis, type 8 (EPCAM)
- Colorectal cancer, somatic (APC)
- Colorectal cancer, somatic (AXIN2)
- Colorectal cancer, somatic (FLCN)
- Colorectal cancer, susceptibility to, 1 (GALNT12)
- Colorectal cancer, susceptibility to, 10 (POLD1)
- Colorectal cancer, susceptibility to, 12 (POLE)
- Colorectal cancer, susceptibility to, 3 (SMAD7)
- Cowden syndrome 1 (PTEN)
- Diamond Blackfan anaemia (RPS20)
- Familial adenomatous polyposis 1 (APC)
- Familial adenomatous polyposis 2 (MUTYH)
- Familial adenomatous polyposis 3 (NTHL1)
- Familial adenomatous polyposis 4 (MSH3)
- Gardner syndrome (APC)
- Juvenile polyposis syndrome, infantile form (BMPR1A)
- Lhermitte-Duclos syndrome (PTEN)
- Peutz-Jeghers syndrome (STK11)
- Polyposis syndrome, hereditary mixed, 2 (BMPR1A)
- Polyposis, juvenile intestinal (BMPR1A)
- Polyposis, juvenile intestinal (SMAD4)
- AD
- AR
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatik und klinische Interpretation
Kein Text hinterlegt