Klinische FragestellungKatarakt [primär isoliert], Differentialdiagnose
Zusammenfassung
Umfassendes differentialdiagnostisches panel für isolierte Katarakt mit 20 "core candidate"-Genen bzw. zusammen genommen 137 kuratierten Genen gemäß klinischer Verdachtsdiagnose
Locus-Typ | Anzahl |
---|---|
Gen | 72 |
123,2 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
- EDTA-Blut (3-5 ml)
NGS +
Loci
Gen
Name | Exon-Länge (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Erbgang |
---|---|---|---|---|
BFSP1 | 1998 | NM_001195.5 | AD, AR | |
BFSP2 | 1248 | NM_003571.4 | AD | |
CHMP4B | 675 | NM_176812.5 | AD | |
CRYAA | 522 | NM_000394.4 | AD, AR | |
CRYBA1 | 648 | NM_005208.5 | AD | |
CRYBB1 | 759 | NM_001887.4 | AD, AR | |
CRYBB2 | 618 | NM_000496.3 | AD | |
CRYBB3 | 636 | NM_004076.5 | AD, AR | |
CRYGC | 525 | NM_020989.4 | AD | |
CRYGD | 525 | NM_006891.4 | AD | |
CRYGS | 537 | NM_017541.4 | AD | |
EPHA2 | 2931 | NM_004431.5 | AD | |
FOXE3 | 960 | NM_012186.3 | AD, AR | |
GCNT2 | 1203 | NM_001491.3 | AR, AD | |
GJA3 | 1308 | NM_021954.4 | AD | |
HSF4 | 1389 | NM_001538.4 | AD | |
MIP | 792 | NM_012064.4 | AD | |
PAX6 | 1269 | NM_000280.5 | AD | |
PITX3 | 909 | NM_005029.4 | AD | |
ABHD12 | 1197 | NM_001042472.3 | AR | |
AGK | 1269 | NM_018238.4 | AR | |
ALDH18A1 | 2388 | NM_002860.4 | AD, AR | |
ATAD3A | 1761 | NM_001170535.3 | AR | |
COL2A1 | 4464 | NM_001844.5 | AD | |
COL4A1 | 5010 | NM_001845.6 | AD | |
COL4A2 | 5139 | NM_001846.4 | AD | |
CRYAB | 528 | NM_001885.3 | AD, AR | |
CRYBA2 | 594 | NM_057093.2 | AD | |
CRYBA4 | 591 | NM_001886.3 | AD | |
CRYGB | 528 | NM_005210.4 | AD | |
CTDP1 | 2529 | NM_004715.5 | AR | |
CYP27A1 | 1596 | NM_000784.4 | AR | |
DHCR7 | 1428 | NM_001360.3 | AR | |
EIF2B2 | 1056 | NM_014239.4 | AR | |
ERCC2 | 2283 | NM_000400.4 | AR | |
ERCC3 | 2349 | NM_000122.2 | AR | |
EYA1 | 1779 | NM_000503.6 | AD | |
FAR1 | 1548 | NM_032228.6 | AD, AR | |
FTL | 528 | NM_000146.4 | AD | |
FYCO1 | 4437 | NM_024513.4 | AR | |
GALK1 | 1179 | NM_000154.2 | AR | |
GALT | 1140 | NM_000155.4 | AR | |
GJA8 | 1302 | NM_005267.5 | AD | |
GTF2H5 | 216 | NM_207118.3 | AR | |
LIM2 | 648 | NM_030657.4 | AR | |
LONP1 | 2688 | NM_001276479.2 | AR | |
LSS | 2303 | NM_001001438.3 | AR | |
MAFA | 1062 | NM_201589.4 | AD | |
NF2 | 1788 | NM_000268.4 | AD | |
NHS | 4425 | NM_001136024.4 | XL | |
OPA3 | 540 | NM_025136.4 | AD | |
PEX10 | 1041 | NM_153818.2 | AR | |
PEX11B | 780 | NM_003846.3 | AR | |
PEX16 | 1011 | NM_004813.4 | AR | |
PEX2 | 918 | NM_000318.3 | AR | |
PEX6 | 2943 | NM_000287.4 | AR | |
PEX7 | 972 | NM_000288.4 | AR | |
POLG | 3720 | NM_002693.3 | AD, AR | |
RAB3GAP2 | 4182 | NM_012414.4 | AR | |
RRAGA | 943 | NM_006570.5 | AD | |
SIL1 | 1386 | NM_022464.5 | AR | |
SIPA1L3 | 5366 | NM_015073.3 | AR | |
SLC16A12 | 1551 | NM_213606.4 | AD | |
SLC2A1 | 1479 | NM_006516.4 | AD | |
SLC40A1 | 1716 | NM_014585.6 | AD | |
SRD5A3 | 957 | NM_024592.5 | AR | |
SREBF1 | 3534 | NM_001005291.3 | AD | |
TDRD7 | 3297 | NM_014290.3 | AR | |
TRPM3 | 768 | NM_001007470.3 | AD | |
UNC45B | 2790 | NM_001033576.2 | AD | |
VIM | 1401 | NM_003380.5 | AD | |
WFS1 | 2673 | NM_006005.3 | AD, AR |
Infos zur Erkrankung
Die angeborene Katarakt ist eine der häufigsten Ursachen für Sehbehinderungen im Kindesalter. Schätzungsweise 1 bis 6 von 10.000 Kindern werden mit einer Trübung der Augenlinsen geboren. Neben Infektionen (Toxoplasmose, Röteln, Zytomegalie) sind in den meisten Fällen Gendefekte Ursache der Katarakt, die nicht selten Bestandteil eines angeborenen Syndroms ist. Mutationen, die eine konnatale Katarakt auslösen, wurden auf über 100 unterschiedlichen Genen gefunden. Die Katarakt kann autosomal-dominant, autosomal-rezessiv oder X-chromosomal-rezessiv vererbt werden.
Literatur: https://www.omim.org/phenotypicSeries/PS116200
- Allelic: Adult i phenotype without cataract (GCNT2)
- Allelic: Alopecia-mental retardation syndrome 4 (LSS)
- Allelic: Angiopathy, hereditary, with nephropathy, aneurysms + muscle cramps (COL4A1)
- Allelic: Aniridia (PAX6)
- Allelic: Aortic aneurysm, familial thoracic 11, susceptibility to (FOXE3)
- Allelic: Ayme-Gripp syndrome (MAF)
- Allelic: Blood group, Ii (GCNT2)
- Allelic: Brain small vessel disease 2 (COL4A2)
- Allelic: Brain small vessel disease with/-out ocular anomalies (COL4A1)
- Allelic: Branchiootic syndrome 1 (EYA1)
- Allelic: Cardiomyopathy, dilated, 1II (CRYAB)
- Allelic: Coloboma, ocular (PAX6)
- Allelic: Deafness, AD 6/14/38 (WFS1)
- Allelic: Diabetes mellitus, noninsulin-dependent, association with (WFS1)
- Allelic: Foveal hypoplasia 1 (PAX6)
- Allelic: Hemorrhage, intracerebral, susceptibility to (COL4A1, COL4A2)
- Allelic: Hypotrichosis 14 (LSS)
- Allelic: Keratitis (PAX6)
- Allelic: L-ferritin deficiency, dominant + recessive (FTL)
- Allelic: Microangiopathy + leukoencephalopathy, pontine, AD (COL4A1)
- Allelic: Morning glory disc anomaly (PAX6)
- Allelic: Myofibrillar myopathy 11 (UNC45B)
- Allelic: Myopathy, myofibrillar, 2 (CRAB)
- Allelic: Myopathy, myofibrillar, fatal infantile hypertonic, alpha-B crystallin-related (CRYAB)
- Allelic: Neurodegeneration with brain iron accumulation 3 (FTL)
- Allelic: Optic nerve hypoplasia (PAX6)
- Allelic: Otofaciocervical syndrome (EYA1)
- Allelic: Retinal arteries, tortuosity of (COL4A1)
- Allelic: Rhizomelic chondrodysplasia punctata, type 1 (PEX7)
- Anterior segment anomalies with/-out cataract (EYA1)
- Anterior segment dysgenesis 1, multiple subtypes (PITX3)
- Anterior segment dysgenesis 2, multiple subtypes (FOXE3)
- Anterior segment dysgenesis 5, multiple subtypes (PAX6)
- Branchiootorenal syndrome 1, with/-out cataracts (EYA1)
- CODAS syndrome [Cerebral, Ocular, Dental, Auricular, Skeletal anomalies s.] (LONP1)
- Cataract 1, multiple types (GJA8)
- Cataract 10, multiple types (CRYBA1)
- Cataract 11, multiple types (PITX3)
- Cataract 11, syndromic, AR (PITX3)
- Cataract 12, multiple types (BFSP2)
- Cataract 13 with adult i phenotype (GCNT2)
- Cataract 14, multiple types (GJA3)
- Cataract 15, multiple types (MIP)
- Cataract 16, multiple types (CRYAB)
- Cataract 17, multiple types (CRYBB1)
- Cataract 18, AR (FYCO1)
- Cataract 19, multiple types (LIM2)
- Cataract 2, multiple types (CRYGC)
- Cataract 20, multiple types (CRYGS)
- Cataract 21, multiple types (MAF)
- Cataract 22 (CRYBB3)
- Cataract 23 (CRYBA4)
- Cataract 3, multiple types (CRYBB2)
- Cataract 30, pulverulent (VIM)
- Cataract 31, multiple types (CHMP4B)
- Cataract 33, multiple types (BFSP1)
- Cataract 34, multiple types (FOXE3)
- Cataract 36 (TDRD7)
- Cataract 38, AR (AGK)
- Cataract 39, multiple types, AD (CRYGB)
- Cataract 4, multiple types (CRYGD)
- Cataract 40, XL (NHS)
- Cataract 41 (WFS1)
- Cataract 42 (CRYBA2)
- Cataract 43 (UNC45B)
- Cataract 44 (LSS)
- Cataract 45 (SIPA1L3)
- Cataract 47, juvenile, with microcornea (SLC16A12)
- Cataract 48 (DNMBP)
- Cataract 49 (PANK4)
- Cataract 5, multiple types (HSF4)
- Cataract 6, multiple types (EPHA2)
- Cataract 9, multiple types (CRYAA)
- Cataract with late-onset corneal dystrophy (PAX6)
- Cataract, AR, due to abnormal sterol metabolism [panelapp] (CYP51A1)
- Cerebrotendinous xanthomatosis (CYP27A1)
- Congenital cataracts, facial dysmorphism + neuropathy (CTDP1)
- Deafness, cataract, impaired intellectual development + polyneuropathy (PSMC3)
- Galactokinase deficiency with cataracts (GALK1)
- Generalized hypotonia, developmental delay, ID, seizures, autistic behavior [panelapp] (TRPM3)
- Hemochromatosis, type 4 (SLC40A1)
- Hyperferritinemia-cataract syndrome (FTL)
- Insulinomatosis + diabetes mellitus (MAFA)
- Isolated paediatric cataract [panelapp; MONDO:0005129] (PGRMC1)
- Marinesco-Sjogren syndrome (SIL1)
- Nance-Horan syndrome (NHS)
- Neurofibromatosis, type 2 (NF2)
- Peroxisome biogenesis disorder 14B (PEX11B)
- Peroxisome biogenesis disorder 9B (PEX7)
- Sengers syndrome (AGK)
- Stickler syndrome, type I, nonsyndromic ocular (COL2A1)
- Wolfram syndrome 1 (WFS1)
- Wolfram-like syndrome, AD (WFS1)
- AD
- AR
- XL
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatik und klinische Interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboranforderung
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.