Klinische FragestellungGlomerulosklerose, fokal-segmentale; Differentialdiagnose
Zusammenfassung
Umfassendes differentialdiagnostisches panel für fokal-segmentale Glomerulosklerose mit 3 Leitlinien-kuratierten Genen, 7 "core candidate"-Genen bzw. insgesamt 64 kuratierten Genen gemäß klinischer Verdachtsdiagnose
| Locus-Typ | Anzahl |
|---|---|
| Gen | 51 |
185,0 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
- EDTA-Blut (3-5 ml)
NGS +
[Sanger]
Loci
Gen
| Name | Exon-Länge (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Erbgang |
|---|---|---|---|---|
| ACTN4 | 2736 | NM_004924.6 | AD | |
| CD2AP | 1920 | NM_012120.3 | AR | |
| COL4A3 | 5013 | NM_000091.5 | AD, AR | |
| COL4A4 | 5073 | NM_000092.5 | AR | |
| COL4A5 | 5058 | NM_000495.5 | XL | |
| COQ8B | 1512 | NM_001142555.3 | AR | |
| INF2 | 3750 | NM_022489.4 | AD | |
| NPHS2 | 1152 | NM_014625.4 | AR | |
| TRPC6 | 2796 | NM_004621.6 | AD | |
| WT1 | 1569 | NM_024426.6 | AD | |
| ALG1 | 1395 | NM_019109.5 | AR | |
| ANLN | 3375 | NM_018685.5 | AD | |
| APOL1 | 1197 | NM_001136540.2 | AR | |
| ARHGAP24 | 2247 | NM_001025616.3 | n.k. | |
| ARHGDIA | 615 | NM_001185077.3 | AR | |
| COQ2 | 1266 | NM_015697.9 | AR | |
| COQ6 | 1407 | NM_182476.3 | AR | |
| CRB2 | 3858 | NM_173689.7 | AR | |
| CUBN | 10872 | NM_001081.4 | AR | |
| DGKE | 1704 | NM_003647.3 | AR | |
| EMP2 | 504 | NM_001424.6 | AR | |
| FAT1 | 13767 | NM_005245.4 | AR | |
| FN1 | 7068 | NM_002026.4 | AD | |
| ITGA3 | 3156 | NM_002204.4 | AR | |
| ITGB4 | 5259 | NM_001005731.3 | n.k. | |
| KANK2 | 2556 | NM_001136191.3 | AR | |
| LAMA5 | 11088 | NM_005560.6 | AR | |
| LAMB2 | 5397 | NM_002292.4 | AR | |
| LMX1B | 1188 | NM_002316.4 | AD | |
| LRP2 | 13968 | NM_004525.3 | AR | |
| MAGI2 | 4368 | NM_012301.4 | AR | |
| MYH9 | 5883 | NM_002473.6 | AD | |
| MYO1E | 3327 | NM_004998.4 | AR | |
| NPHP4 | 4281 | NM_015102.5 | AR | |
| NPHS1 | 3726 | NM_004646.4 | AR | |
| NUP107 | 2778 | NM_020401.4 | AR | |
| NUP205 | 6082 | NM_015135.3 | AR | |
| NUP93 | 2665 | NM_014669.5 | AR | |
| PAX2 | 1254 | NM_003987.5 | AD | |
| PDSS2 | 1200 | NM_020381.4 | AR | |
| PLCE1 | 6909 | NM_016341.4 | AR | |
| PMM2 | 741 | NM_000303.3 | AR | |
| PODXL | 1677 | NM_001018111.3 | AD | |
| PTPRO | 3651 | NM_030667.3 | AR | |
| SCARB2 | 1437 | NM_005506.4 | AR | |
| SGPL1 | 1721 | NM_003901.4 | AR | |
| SMARCAL1 | 2865 | NM_001127207.2 | AR | |
| SYNPO | 2058 | NM_001109974.3 | n.k. | |
| TP53RK | 762 | NM_033550.4 | AR | |
| TTC21B | 3951 | NM_024753.5 | AR, AD | |
| WDR73 | 1137 | NM_032856.5 | AR |
Infos zur Erkrankung
Die fokale segmentale Glomerulosklerose (FSGS) beschreibt ein charakteristisches histologisches Muster im Nierengewebe, das mit verschiedenen zu Grunde liegenden Ursachen assoziiert ist, die alle auf eine gemeinsame Schädigung der Podocyten zurückzuführen sind. Für die Klassifizierung der FSGS wurde ein Pathomechanismus-basierter Ansatz vorgeschlagen. Dieser Ansatz unterscheidet zwischen primären, sekundären, genetischen und ungeklärten Ursachen. Genetische FSGS aufgrund monogener Mutationen kann im Kindes- oder Erwachsenenalter auftreten. Bei familiärer Vorbelastung mit chronischer Nierenerkrankung, nephrotischem Syndrom oder Therapieresistenz ist eine genetische Untersuchung ratsam. Primäre FSGS tritt häufig bei Jugendlichen und jungen Erwachsenen auf, kann aber in jedem Alter vorkommen. Klinisch ist sie typischerweise mit einer Proteinurie im nephrotischen Bereich, Hypoalbuminämie und Hyperlipidämie assoziiert. Das klinische Bild ist variabel; einige Gene sind mit extrarenalen Manifestationen verbunden und liefern somit einen klinischen Hinweis. Das hier verwendete Genpanel umfasst sowohl nicht-syndromische als auch syndromische Formen der FSGS.
Literatur: Bonilla et al. (2024) Kidney Medicine 6:100826
- Alias: Focal segmental glomerulosclerosis; FSGS
- Allelic: Cerebral palsy, spastic quadriplegic, 2 (KANK1)
- Allelic: Deafness, AD 17 (MYH9)
- Allelic: Denys-Drash-, Frasier-, Meacham syndrome; Mesothelioma, somatic; Wilms tumor, type 1 (WT1)
- Allelic: Epidermolysis bullosa of hands and feet (ITGB4)
- Allelic: Epidermolysis bullosa, junctional, non-Herlitz type (ITGB4)
- Allelic: Epidermolysis bullosa, junctional, with pyloric atresia (ITGB4)
- Allelic: Hematuria, benign familial (COL4A3, COL4A4)
- Allelic: Palmoplantar keratoderma + woolly hair (KANK2)
- Allelic: Short-rib thoracic dysplasia 4 with/-out polydactyly (TTC21B)
- Alport syndrome 1, XL (COL4A5)
- Alport syndrome 2, AR (COL4A3, COL4A4)
- Alport syndrome 3, AD (COL4A3)
- Coenzyme Q10 deficiency, primary, 1 (COQ2)
- Coenzyme Q10 deficiency, primary, 3 (PDSS2)
- Coenzyme Q10 deficiency, primary, 6 (COQ6)
- Congenital disorder of glycosylation, type Ia (PMM2)
- Congenital disorder of glycosylation, type Ik (ALG1)
- Congenital nephrotic syndrome [panelapp green] (PODXL)
- Donnai-Barrow syndrome (LRP2)
- End-stage renal disease, nondiabetic, susceptibility to (APOL1)
- Epidermolysis bullosa simplex 7, with nephropathy + deafness (CD151)
- Epilepsy, progressive myoclonic 4, with/-out renal failure (SCARB2)
- Focal segmental glomerulosclerosis + neurodevelopmental syndrome (TRIM8)
- Focal segmental glomerulosclerosis 10 (LMX1B)
- Focal segmental glomerulosclerosis 8 (ANLN)
- Focal segmental glomerulosclerosis 9 (CRB2)
- Focal segmental glomerulosclerosis [panelapp red] (E2F3)
- Focal segmental glomerulosclerosis [panelapp red] (SYNPO)
- Galloway-Mowat syndrome 1 (WDR73)
- Galloway-Mowat syndrome 2, XL (LAGE3)
- Galloway-Mowat syndrome 3 (OSGEP)
- Galloway-Mowat syndrome 4 (TP53RK)
- Galloway-Mowat syndrome 5 (TPRKB)
- Galloway-Mowat syndrome 7 (NUP107)
- Galloway-Mowat syndrome 8 (NUP133)
- Glomerulopathy with fibronectin deposits 2 (FN1)
- Glomerulosclerosis, focal segmental, 1 (ACTN4)
- Glomerulosclerosis, focal segmental, 2 (TRPC6)
- Glomerulosclerosis, focal segmental, 3 (CD2AP)
- Glomerulosclerosis, focal segmental, 4, susceptibility to (APOL1)
- Glomerulosclerosis, focal segmental, 5 (INF2)
- Glomerulosclerosis, focal segmental, 6 (MYO1E)
- Glomerulosclerosis, focal segmental, 7 (PAX2)
- Glomerulotubular nephropathy [panelapp] (FAT1)
- Hemolytic uremic syndrome, atypical, susceptibility to, 7 (DGKE)
- Imerslund-Grasbeck syndrome 1 (CUBN)
- Interstitial lung disease, nephrotic syndrome, epidermolysis bullosa, congenital (ITGA3)
- Macrothrombocytopenia + granulocyte inclus. with/-out nephritis or sensorineural hearing loss (MYH9)
- Nail-patella syndrome (LMX1B)
- Nephronophthisis 12 (TTC21B)
- Nephronophthisis 4 (NPHP4)
- Nephrotic syndrome [panelapp] (LAMA5)
- Nephrotic syndrome [panelapp] (XPO5)
- Nephrotic syndrome, type 1 (NPHS1)
- Nephrotic syndrome, type 10 (EMP2)
- Nephrotic syndrome, type 11 (NUP107)
- Nephrotic syndrome, type 12 (NUP93)
- Nephrotic syndrome, type 13 (NUP205)
- Nephrotic syndrome, type 14 (SGPL1)
- Nephrotic syndrome, type 15 (MAGI2)
- Nephrotic syndrome, type 16 (KANK2)
- Nephrotic syndrome, type 17 (NUP85)
- Nephrotic syndrome, type 18 (NUP133)
- Nephrotic syndrome, type 19 (NUP160)
- Nephrotic syndrome, type 2 (NPHS2)
- Nephrotic syndrome, type 20 (TBC1D8B)
- Nephrotic syndrome, type 21 (AVIL)
- Nephrotic syndrome, type 3 (PLCE1)
- Nephrotic syndrome, type 4 (WT1)
- Nephrotic syndrome, type 5, with/-out ocular abnormalities (LAMB2)
- Nephrotic syndrome, type 6 (PTPRO)
- Nephrotic syndrome, type 7 (DGKE)
- Nephrotic syndrome, type 8 (ARHGDIA)
- Nephrotic syndrome, type 9 (COQ8B)
- Papillorenal syndrome (PAX2)
- Pierson syndrome (LAMB2)
- Proteinuria, chronic benign (CUBN)
- Proteinuric renal disease [panelapp] (GAPVD1)
- Schimke immunoosseous dysplasia (SMARCAL1)
- Senior-Loken syndrome 4 (NPHP4)
- Steroid-resistant nephrotic syndrome [GeneReviews] (ANKFY1)
- Ventriculomegaly with cystic kidney disease (CRB2)
- AD
- AR
- XL
- n.k.
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatik und klinische Interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboranforderung
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.