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Klinische FragestellungGestörter Cobalamin-Metabolismus, Differentialdiagnose

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Zusammenfassung

Kurzinformation

Umfassendes differentialdiagnostisches panel für Störungen im Cobalamin Metabolismus mit 7 bzw. 21 kuratierten Genen gemäß klinischer Verdachtsdiagnose

ID
CP4527
Anzahl Loci
Locus-TypAnzahl
Gen 21
Akkreditierte Untersuchung
Untersuchte Sequenzlänge
20,9 kb (Core-/Core-canditate-Gene)
46,8 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
Analyse-Dauer
auf Anfrage
Untersuchungsmaterial
  • EDTA-Blut (3-5 ml)
Diagnostische Hinweise

NGS +

 

Loci

Gen

NameExon-Länge (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Erbgang
ABCD41821NM_005050.4AR
CBS1656NM_000071.3AR
HCFC16108NM_005334.3XLR
LMBRD11623NM_018368.4AR
MMACHC849NM_015506.3AR
MMADHC891NM_015702.3AR
MTHFR1971NM_005957.5AR
MTR3798NM_000254.3AR
MTRR2097NM_002454.3AR
ACSF31731NM_001127214.4AR
AMN1362NM_030943.4AR
CBLIF1254NM_005142.3AR
CD320849NM_016579.4AR
CUBN10872NM_001081.4AR
MMAA1257NM_172250.3AR
MMAB753NM_052845.4AR
MMUT2253NM_000255.4AR
SUCLA21392NM_003850.3AR
TCN21284NM_000355.4AR
THAP11946NM_020457.3AR
ZNF1431935NM_003442.6AR

Infos zur Erkrankung

Klinischer Kommentar

Angeborene Störungen des Cobalamin-Stoffwechsels sind eine Gruppe von Erkrankungen, die durch enzymatische Defekte im Cobalamin-Verarbeitungsprozess verursacht werden. Sie werden bei Patienten mit erhöhten Methylmalonsäure- oder Homocysteinwerten, oder beidem, vermutet, wenn kein diätetischer Cobalaminmangel vorliegt. Störungen, die die intestinale Resorption beeinträchtigen, führen zu erniedrigten Cobalamin-Blutspiegeln, während die meisten anderen Erkrankungen mit Serumspiegeln innerhalb des Referenzbereichs einhergehen. Mit der Identifizierung der allen diesen Störungen zugrunde liegenden Gene hat sich die gezielte Gensequenzierung zum primären Diagnoseverfahren entwickelt.

Literatur: PMID: 35337626

 

Synonyme
  • Alias: Cobalamin-Stoffwechsel- und Transport-Störung
  • Alias: Disorders of Intracellular Cobalamin Metabolism
  • Allelic: Neural tube defects, folate-sensitive, susceptibility to (MTR, MTRR)
  • Allelic: Neural tube defects, susceptibility to (MTHFR)
  • Allelic: Schizophrenia, susceptibility to (MTHFR)
  • Allelic: Thromboembolism, susceptibility to (MTHFR)
  • Allelic: Thrombosis, hyperhomocysteinemic (CBS)
  • Allelic: Vascular disease, susceptibility to (MTHFR)
  • Combined malonic + methylmalonic aciduria (ACSF3)
  • Disorder of intracellular cobalamin metabolism (THAP11, ZNF143)
  • Homocystinuria due to MTHFR deficiency (MTHFR)
  • Homocystinuria, B6-responsive + nonresponsive types (CBS)
  • Homocystinuria, cblD type, variant 1 (MMADHC)
  • Homocystinuria-megaloblastic anemia, cbl E type (MTRR)
  • Homocystinuria-megaloblastic anemia, cblG complementation type (MTR)
  • Imerslund-Grasbeck syndrome 1 (CUBN)
  • Imerslund-Grasbeck syndrome 2 (AMN)
  • Intrinsic factor deficiency (GIF syn. CBLIF)
  • Mental retardation, XL 3; methylmalonic acidemia + homocysteinemia, cblX type (HCFC1)
  • Methylmalonic aciduria + homocystinuria, cblC type (MMACHC)
  • Methylmalonic aciduria + homocystinuria, cblC type, digenic (PRDX1)
  • Methylmalonic aciduria + homocystinuria, cblD type (MMADHC)
  • Methylmalonic aciduria + homocystinuria, cblF type (LMBRD1)
  • Methylmalonic aciduria + homocystinuria, cblJ type (ABCD4)
  • Methylmalonic aciduria, cblD type, variant 2 (MMHDAC)
  • Methylmalonic aciduria, mut[0] type (MUT)
  • Methylmalonic aciduria, transient, due to transcobalamin receptor defect (CD320)
  • Methylmalonic aciduria, vitamin B12-responsive, cblA type (MMAA)
  • Methylmalonic aciduria, vitamin B12-responsive, cblB type (MMAB)
  • MtDNA depletion syndrome 5, encephalomyopathic with/-out methylmalonic aciduria (SUCLA2)
  • Transcobalamin II deficiency (TCN2)
Erbgänge, Vererbungsmuster etc.
  • AR
  • XLR
OMIM-Ps
  • Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatik und klinische Interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboranforderung

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.