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Interdisciplinary CompetenceMolecular Diagnostics
Know how in the analysis of genetic material.
For the benefit of patients.

IllnessNeuropathy, CMT1/-4/-X, demyelinating; differential diagnosis

Summary

Short information

Comprehensive differential diagnostic panel for Neuropathy, CMT1/-4/-X, demyelinating, comprising 6 core genes, in addition 24 core candidate genes and altogether 29 guideline-curated genes according to the clinical signs

ID
NP1231
Number of genes
25 Accredited laboratory test
Examined sequence length
42,9 kb (Core-/Core-canditate-Genes)
52,4 kb (Extended panel: incl. additional genes)
Analysis Duration
on request
Material
  • EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
Diagnostic indications

NGS +

 

Gene panel

Selected genes

NameExon Length (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Heredity
DNM22613NM_001005360.3AD
EGR21431NM_000399.5AD
FGD42301NM_139241.3AR
FIG42724NM_014845.6AD, AR
GDAP11077NM_018972.4AD, AR
GJB1852NM_000166.6XL
HK12754NM_000188.3AR
LITAF486NM_004862.4AD
MPZ747NM_000530.8AD
MTMR21932NM_016156.6AR
NDRG11185NM_006096.4AR
NEFL1633NM_006158.5AD, AR
PDK31248NM_001142386.3XL
PMP22483NM_000304.4AD
PRPS1957NM_002764.4XL
PRX4386NM_181882.3AR
SBF15682NM_002972.4AR
SBF25550NM_030962.4AR
SH3TC23867NM_024577.4AR
SURF1903NM_003172.4AR
CNTNAP14155NM_003632.3AR
CTDP12529NM_004715.5AR
FBLN51347NM_006329.4AD
PMP2403NM_002677.5AD
SORD1074NM_003104.6AR

Informations about the disease

Clinical Comment

Hereditary motor and sensory neuropathies (HMSN) or Charcot-Marie-Tooth (CMT) disorders and related neuropathies are a group of clinically and genetically heterogeneous conditions primarily affecting the peripheral nervous system with secondary muscle wasting and weakness. CMT is the most common inherited neuromuscular disorder, and patients with CMT and other HMSNs may present with many symptoms, with motor signs predominating over sensory symptoms in all age groups. Onset can occur in infancy, adolescence or throughout life with mild symptoms - even asymptomatic relatives can be detected in respective families. Motor nerve conduction velocities (NCV) distinguish two main types: CMT1 (demyelinating; NCV<35m/sec) and CMT2 (axonal; NCV>45m/sec). CMT1 accounts for 2/3 of all CMT cases. CMT neuropathy can be inherited either autosomal dominantly, recessively or X-linked (CMTX forms) and often occurs as a sporadic neuropathy. To date, over 60 different genetic loci have been associated with CMT1-4, CMTX and CMTdi (dominant intermediate type; NCV 35-45m/sec). Almost all of the relevant genes have been identified. These genes encode proteins involved in myelination, Schwann cell differentiation, axonal transport, endocytic recycling, mitochondrial function, protein translation, signal transduction, single-strand DNA break repair, and other processes. DNA diagnostic yields reported to date for all forms of CMT vary considerably from >20% to >60%, probably depending on the degree of clinical workup. Negative molecular genetic results by no means exclude clinical diagnosis.

Reference: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1358/

 

Synonyms
  • Alias: CMT1 + CMT4 + CMTX
  • Alias: HMSNI + HMSNIV + HMSNX
  • Alias: Polyneuropathie
  • Allelic: Arts syndrome (PRPS1)
  • Allelic: Cutis laxa, AD 2 (FBLN5)
  • Allelic: Cutis laxa, AR, type IA (FBLN5)
  • Allelic: Deafness, XL 1 (PRPPS1)
  • Allelic: Dejerine-Sottas disease (EGR2, MPZ, PMP22, PRX)
  • Allelic: Gout, PRPS-related (PRPS1)
  • Allelic: Hypomyelinating neuropathy, congenital, 2 (MPZ)
  • Allelic: Macular degeneration, age-related, 3 (FBLN5)
  • Allelic: Mononeuropathy of the median nerve, mild (SH3TC2)
  • Allelic: Phosphoribosylpyrophosphate synthetase superactivity (PRPS1)
  • Allelic: Roussy-Levy syndrome (MPZ, PMP22)
  • Amyotrophic lateral sclerosis 11 (FIG4)
  • Charcot-Marie-Tooth disease, DI D (MPZ)
  • Charcot-Marie-Tooth disease, DI G (NEFL)
  • Charcot-Marie-Tooth disease, RI, A (GDAP1)
  • Charcot-Marie-Tooth disease, XLD, 6 (PDK3)
  • Charcot-Marie-Tooth disease, XLR, 5 (PRPS1)
  • Charcot-Marie-Tooth disease, axonal, type 2K (GDAP1)
  • Charcot-Marie-Tooth disease, axonal, with vocal cord paresis (GDAP1)
  • Charcot-Marie-Tooth disease, type 1A (PMP22)
  • Charcot-Marie-Tooth disease, type 1B (MPZ)
  • Charcot-Marie-Tooth disease, type 1C (LITAF)
  • Charcot-Marie-Tooth disease, type 1D (EGR2)
  • Charcot-Marie-Tooth disease, type 1E (PMP22)
  • Charcot-Marie-Tooth disease, type 1F (NEFL)
  • Charcot-Marie-Tooth disease, type 2E (NEFL)
  • Charcot-Marie-Tooth disease, type 2I (MPZ)
  • Charcot-Marie-Tooth disease, type 2J (MPZ)
  • Charcot-Marie-Tooth disease, type 4A (GDAP1)
  • Charcot-Marie-Tooth disease, type 4B1 (MTMR2)
  • Charcot-Marie-Tooth disease, type 4B2 (SFB2)
  • Charcot-Marie-Tooth disease, type 4C (SH3TC2)
  • Charcot-Marie-Tooth disease, type 4D (NDRG1)
  • Charcot-Marie-Tooth disease, type 4F (PRX)
  • Charcot-Marie-Tooth disease, type 4H (FGD4)
  • Charcot-Marie-Tooth disease, type 4J (FIG4)
  • Charcot-Marie-Tooth neuropathy, XLD, 1 (GJB1)
  • Cowchock syndrome (AIFM1)
  • Hypomyelinating neuropathy, congenital, 1 (EGR2)
  • Neuropathy, hereditary, with/-out age-related macular degeneration (FBLN5)
  • Neuropathy, recurrent, with pressure palsies (PMP22)
Heredity, heredity patterns etc.
  • AD
  • AR
  • XL
OMIM-Ps
  • Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatics and clinical interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboratory requirement

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.