IllnessRett syndrome

Summary

Short information

Guideline-curated single gene sequence analysis according to the clinical suspicion Rett syndrome

RS5080

Number of loci

Locus type	Count
Gen	1

Accredited laboratory test

Examined sequence length

1,5 kb (Core-/Core-canditate-Genes)
- (Extended panel: incl. additional genes)

Analysis Duration

on request

Test material

EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)

Diagnostic indications

NGS +

Sanger

Loci

Gen

Name	Exon Length (bp)	OMIM-G	Referenz-Seq.	Heredity
MECP2	1461	300005	NM_004992.4	XL

Informations about the disease

Clinical Comment

Neurological disorder almost exclusively affecting girls with rapid developmental regression in infancy, loss of purposeful hand movements + speech, gait abnormalities, repetitive stereotypic hand movements; severe intellectual disability, microcephaly, seizures, breathing abnormalities, disturbed sleeping patterns, scoliosis, impaired social interactions or social withdrawal etc.; progresses in stages, with late motor deterioration eventually leading to decreased mobility, muscle weakness, rigidity, spasticity, dystonia

Synonyms

Allelic: Autism susceptibility, XL 3 (MECP2)
Allelic: Encephalopathy, neonatal severe (MECP2)
Allelic: Mental retardation, XL syndromic, Lubs type (MECP2)
Allelic: Mental retardation, XL, syndromic 13 (MECP2)
Rett syndrome (MECP2)
Rett syndrome, atypical (MECP2)
Rett syndrome, preserved speech variant (MECP2)

Heredity, heredity patterns etc.

OMIM-Ps

300005

ICD10 Code

Bioinformatics and clinical interpretation

Test-Stärken

DAkkS-akkreditiertes Labor
EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
Gen-Konversionen
komplexe Inversionen
Balancierte Translokationen
Mitochondriale Varianten
Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
niedriger Mosaik-Status
Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
Varianten innerhalb von Pseudogenen
die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboratory requirement

Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.