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Interdisciplinary CompetenceMolecular Diagnostics
Know how in the analysis of genetic material.
For the benefit of patients.

IllnessNystagmus, infantile; differential diagnosis

Summary

Short information

Comprehensive differential diagnostic panel for Nystagmus, infantile, comprising 1 guideline-curated gene and altogether 18 curated genes according to the clinical signs

ID
NP0930
Number of genes
20 Accredited laboratory test
Examined sequence length
19,6 kb (Core-/Core-canditate-Genes)
72,3 kb (Extended panel: incl. additional genes)
Analysis Duration
on request
Material
  • EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
Diagnostic indications

NGS +

 

Gene panel

Selected genes

NameExon Length (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Heredity
CACNA1A6786NM_001127221.2AD
FRMD72145NM_194277.3XL
GPR1431215NM_000273.3XL
LRMDA597NM_032024.5AR
OCA22517NM_000275.3AR
SLC24A51503NM_205850.3AR
SLC45A21593NM_016180.5AR
TYR1590NM_000372.5AR
TYRP11614NM_000550.3AR
AHR2547NM_001621.5AR
CACNA1F5934NM_005183.4XLR
CASK2766NM_003688.3XLR
LYST11406NM_000081.4AR
MANBA2640NM_005908.4AR
NYX1446NM_022567.2XLR
PAX61269NM_000280.5AD
SACS13740NM_014363.6AR
SETX8034NM_015046.7AD, AR
SLC38A81308NM_001080442.3AR
TULP11629NM_003322.6AR

Informations about the disease

Clinical Comment

Infantile nystagmus syndrome (INS) can occur in isolation or as part of a variety of ocular or systemic disorders, including albinism, retinal disorders and neurologic disorders. Nystagmus may be present at birth or develop within the first six months of life. Eye movements may worsen if the affected person is anxious or tries to stare directly at an object. The severity of nystagmus varies, even among affected individuals within the same family. Sometimes affected individuals turn or tilt their head to compensate for the irregular eye movements. Although FRMD7 gene mutations are the only known genetic cause of idiopathic INS to date, there are many disorders that can masquerade as nystagmus in children. These disorders are often overlooked, because it is difficult to identify associated phenotypes (such as hypomorphic albinism) or because additional clinical features, such as spinocerebellar ataxia, appear late. All Mendelian inheritance patterns can be observed, as mutations in several different genes cause INS. Yet no mutations have been identified in some INS patients, so the diagnostic yield is currently 40-60%, which depends largely on panel composition and detailed clinical characterization. Therefore, the clinical diagnosis is not ruled out by a negative DNA test result.

References: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK3822/

https://www.nature.com/articles/s41598-019-49368-7#MOESM1/

 

Synonyms
  • Allelic: Epileptic encephalopathy, early infantile, 42 (CACNA1A)
  • Allelic: Melanoma, cutaneous malignant, susceptibility to, 8 (TYR)
  • Allelic: Migraine, familial hemiplegic, 1 (CACNA1A)
  • Allelic: Skin/hair/eye pigmentation 1, blond/brown hair (OCA2)
  • Allelic: Skin/hair/eye pigmentation 1, blue/nonblue eyes (OCA2)
  • Allelic: Skin/hair/eye pigmentation 3, blue/green eyes (TYR)
  • Allelic: Skin/hair/eye pigmentation 3, light/dark/freckling skin (TYR)
  • Allelic: Skin/hair/eye pigmentation 4, fair/dark skin (SLC24A5)
  • Allelic: Skin/hair/eye pigmentation 5, black/nonblack hair (SCL45A2)
  • Allelic: Skin/hair/eye pigmentation 5, dark/fair skin (SLC45A2)
  • Allelic: Skin/hair/eye pigmentation 5, dark/light eyes (SLC45A2)
  • Allelic: Skin/hair/eye pigmentation, variation in, 11 [Melanesian blond hair] (TYRP1)
  • Aland Island eye disease (CACNA1F)
  • Albinism, brown oculocutaneous (OCA)
  • Albinism, oculocutaneous, type IA + IB (TYR)
  • Albinism, oculocutaneous, type II (OCA2)
  • Albinism, oculocutaneous, type III (TYRP1)
  • Albinism, oculocutaneous, type IV (SLC45A2)
  • Albinism, oculocutaneous, type VI (SLC24A5)
  • Albinism, oculocutaneous, type VII (LRMDA)
  • Allelic: Amyotrophic lateral sclerosis 4, juvenile (SETX)
  • Allelic: Aniridia (PAX6)
  • Allelic: Anterior segment dysgenesis 5, multiple subtypes (PAX6)
  • Allelic: Cataract with late-onset corneal dystrophy (PAX6)
  • Allelic: Coloboma of optic nerve (PAX6)
  • Allelic: Coloboma, ocular (PAXY6)
  • Allelic: Keratitis (PAX6)
  • Allelic: Morning glory disc anomaly (PAX6)
  • Allelic: Optic nerve hypoplasia (PAX6)
  • Allelic: Retinitis pigmentosa 14 (TULP1)
  • Chediak-Higashi syndrome (LYST)
  • Cone-rod dystrophy, XL, 3 (CACNA1F)
  • Episodic ataxia, type 2 (CACNA1A)
  • FG syndrome 4 (CASK)
  • Foveal hypoplasia 1 (PAX6)
  • Foveal hypoplasia 2, +/- optic nerve misrouting +/+ anterior segment dysgenesis (SLC38A8)
  • Intellectual developmental disorder + microcephaly with pontine + cerebellar hypoplasia (CASK)
  • Leber congenital amaurosis 15 (TULP1)
  • Mannosidosis, beta (MANBA)
  • Mental retardation, with or without nystagmus (CASK)
  • Migraine, familial hemiplegic, 1, with progressive cerebellar ataxia (CACNA1A)
  • Night blindness, congenital stationary (incomplete), 2A, XL (CACNA1F)
  • Night blindness, congenital stationary, complete, 1A, XL (NYX)
  • Nystagmus 1, congenital, XL (FRMD7)
  • Nystagmus 6, congenital, XL (GPR143)
  • Nystagmus, infantile periodic alternating, XL (FRMD7)
  • Ocular albinism, type I, Nettleship-Falls type (GPR143)
  • Retinitis pigmentosa 85 (AHR)
  • Spastic ataxia, Charlevoix-Saguenay type (SACS)
  • Spinocerebellar ataxia 6 (CACNA1A)
  • Spinocerebellar ataxia, AR, with axonal neuropathy 2 (SETX)
  • Waardenburg syndrome/albinism, digenic (TYR)
Heredity, heredity patterns etc.
  • AD
  • AR
  • XL
  • XLR
OMIM-Ps
  • Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatics and clinical interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboratory requirement

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.