IllnessNeuronopathy / muscular atrophy, distal hereditary; differential diagnosis

Summary

Short information

Comprehensive differential diagnostic panel for Neuronopathy/ muscular atrophy, distal hereditary, comprising 4 core genes, 6 core candidate genes and altogether 29 curated genes according to the clinical signs

MP0450

Number of loci

Locus type	Count
Gen	29

Accredited laboratory test

Examined sequence length

19,4 kb (Core-/Core-canditate-Genes)
78,1 kb (Extended panel: incl. additional genes)

Analysis Duration

on request

Test material

EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)

Diagnostic indications

NGS +

Loci

Gen

Name	Exon Length (bp)	OMIM-G	Referenz-Seq.	Heredity
BICD2	2568	609797	NM_001003800.2	AR
BSCL2	1197	606158	NM_032667.6	AD
DHTKD1	2760	614984	NM_018706.7	AD
DNAJB2	834	604139	NM_001039550.2	AR
GARS1	2220	600287	NM_002047.4	AD
HSPB1	618	602195	NM_001540.5	AD
IGHMBP2	2982	600502	NM_002180.3	AR
MFN2	2274	608507	NM_014874.4	AD
SYT2	1260	600104	NM_177402.5	AD
TRPV4	2616	605427	NM_021625.5	AD
AARS1	2927	601065	NM_001605.3	AR
AR	2763	313700	NM_000044.6	XLR
ARHGEF10	4035	608136	NM_014629.4	AD
ATP7A	4503	300011	NM_000052.7	XLR
CHCHD10	429	615903	NM_213720.3	AR
DCTN1	3837	601143	NM_004082.5	AD
DYNC1H1	13941	600112	NM_001376.5	AD
FBXO38	2832	608533	NM_001271723.2	AD
HSPB8	591	608014	NM_014365.3	AD
PLEKHG5	3189	611101	NM_020631.6	AR
PNPLA6	3984	603197	NM_006702.5	AR
REEP1	606	609139	NM_022912.3	AR
SLC52A3	1410	613350	NM_033409.4	AR
SLC5A7	1743	608761	NM_021815.5	AD
SMN1	885	600354	NM_000344.4	AR
SORD	1074	182500	NM_003104.6	AR
SPG11	7332	610844	NM_025137.4	AR
VRK1	1191	602168	NM_003384.3	AR
WARS1	1451	191050		AD

Informations about the disease

Clinical Comment

Heterogeneous disorders caused by lower motor neuron dysfunction with length-dependent motor weakness + atrophy, initially affecting intrinsic foot muscles + peroneal compartment of legs, frequently leading to foot deformities, pes cavus, planus, clawing of toes

https://n.neurology.org/content/neurology/early/2017/03/01/WNL.0000000000003772.full.pdf

Synonyms

Alias: dHMN distal Hereditary MotoNeuropathy
Allelic: Alpha-aminoadipic + alpha-ketoadipic aciduria (DHTKD1)
Allelic: Amyotrophic lateral sclerosis 8 (VAPB)
Allelic: Amyotrophic lateral sclerosis, susceptibility to (DCTN1)
Allelic: Androgen insensitivity (AR)
Allelic: Androgen insensitivity, partial, +/- breast cancer (AR)
Allelic: Boucher-Neuhauser syndrome (PNPLA6)
Allelic: Developmental and epileptic encephalopathy 29 (AARS1)
Allelic: Encephalopathy, progressive, with/-out lipodystrophy (BSCL2)
Allelic: Farber Lipogranulomatosis (ASAH1)
Allelic: Frontotemporal dementia and/or amyotrophic lateral sclerosis 2 (CHCHD10)
Allelic: Hypospadias 1, XL (AR)
Allelic: Leukoencephalopathy, hereditary diffuse, with spheroids 2 (AARS1)
Allelic: Lipodystrophy, congenital generalized, type 2 (BSCL2)
Allelic: Muscular dystrophy, congenital, Davignon-Chauveau type (TRIP4)
Allelic: Myasthenic syndrome, congenital, 20, presynaptic (SLC5A7)
Allelic: Myopathy, isolated mitochondrial, AD (CHCHD10)
Allelic: Primary lateral sclerosis, juvenile (ALS2)
Allelic: Trichothiodystrophy 8, nonphotosensitive (AARS1)
Allelic: VEXAS syndrome, somatic (UBA1)
Amyotrophic lateral sclerosis 2, juvenile (ALS2)
Amyotrophic lateral sclerosis 5, juvenile (SPG11)
Brown-Vialetto-Van Laere syndrome 1 (SLC52A3)
Brown-Vialetto-Van Laere syndrome 2 (SLC52A2)
Charcot-Marie-Tooth disease, axonal, type 2F (HSPB1)
Charcot-Marie-Tooth disease, axonal, type 2L (HSPB8)
Charcot-Marie-Tooth disease, axonal, type 2N (AARS1)
Charcot-Marie-Tooth disease, axonal, type 2Q (DHTKD1)
Charcot-Marie-Tooth disease, axonal, type 2S (IGHMBP2)
Charcot-Marie-Tooth disease, axonal, type 2X (SPG11)
Charcot-Marie-Tooth disease, type 2D (GARS1)
Distal hereditary motor neuropathy
Distal spinal muscular atrophy
Fazio-Londe disease (SLC52A3)
Hereditary motor + sensory neuropathy VIA (MFN2)
Hereditary motor + sensory neuropathy, type IIc (TRPV4)
Laurence-Moon syndrome (PNPLA6)
Myasthenic syndrome, congenital, 7A, presynaptic, distal motor neuropathy, AD (SYT2)
Myasthenic syndrome, congenital, 7B, presynaptic, AR (SYT2)
Neuronopathy, distal hereditary motor, type IIA (HSPB8)
Neuronopathy, distal hereditary motor, type IIB (HSPB1)
Neuronopathy, distal hereditary motor, type IIC (HSPB3)
Neuronopathy, distal hereditary motor, type IID (FBXO38)
Neuronopathy, distal hereditary motor, type IX (WARS1)
Neuronopathy, distal hereditary motor, type VA (GARS1)
Neuronopathy, distal hereditary motor, type VB (REEP1)
Neuronopathy, distal hereditary motor, type VI (IGHMBP2)
Neuronopathy, distal hereditary motor, type VIIA (SLC5A7)
Neuronopathy, distal hereditary motor, type VIIB (DCTN1)
Neuronopathy, distal hereditary motor, type VIII (TRPV4)
Neuropathy, distal hereditary motor, type VA (BSCL2)
Oliver-McFarlane syndrome (PNPLA6)
Perry syndrome (DCTN1)
Pontocerebellar hypoplasia type 1A (VRK1)
Pontocerebellar hypoplasia, type 1B (EXOSC3)
Pontocerebellar hypoplasia, type 1C (EXOSC8)
SMA, distale Form
Silver spastic paraplegia syndrome (BSCL2)
Slowed nerve conduction velocity, AD (ARHGEF10)
Sorbitol dehydrogenase deficiency with peripheral neuropathy (SORD)
Spastic paralysis, infantile onset ascending (ALS2)
Spastic paraplegia 11, AR (SPG11)
Spastic paraplegia 31, AD (REEP1)
Spastic paraplegia 39, AR (PNPLA6)
Spinal + bulbar muscular atrophy of Kennedy (AR_CAG)
Spinal and bulbar muscular atrophy of Kennedy (AR)
Spinal muscular atrophy with congenital bone fractures 1 (TRIP4)
Spinal muscular atrophy with progressive myoclonic epilepsy (ASAH1)
Spinal muscular atrophy, Jokela type (CHCHD10)
Spinal muscular atrophy, XL 2, infantile (UBA1)
Spinal muscular atrophy, distal, AR, 2 (SIGMAR1)
Spinal muscular atrophy, distal, AR, 4 (PLEKHG5)
Spinal muscular atrophy, distal, AR, 5 (DNAJB2)
Spinal muscular atrophy, distal, XL 3 (ATP7A)
Spinal muscular atrophy, late-onset, Finkel type (VAPB)
Spinal muscular atrophy, lower extremity-predominant 1, AD (DYNC1H1)
Spinal muscular atrophy, lower extremity-predominant, 2A, AD (BICD2)
Spinal muscular atrophy, lower extremity-predominant, 2B, AD (BICD2)
Spinal muscular atrophy-1, -2, -3, -4 (SMN1)

Heredity, heredity patterns etc.

OMIM-Ps

Multiple OMIM-Ps

ICD10 Code

Bioinformatics and clinical interpretation

Test-Stärken

DAkkS-akkreditiertes Labor
EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
Gen-Konversionen
komplexe Inversionen
Balancierte Translokationen
Mitochondriale Varianten
Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
niedriger Mosaik-Status
Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
Varianten innerhalb von Pseudogenen
die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboratory requirement

Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.