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Interdisciplinary CompetenceMolecular Diagnostics
Know how in the analysis of genetic material.
For the benefit of patients.

IllnessMultiple endocrine tumors, differential diagnosis

Summary

Short information

Comprehensive differential diagnostic panel for Multiple endocrine tumors comprising 4 guideline-curated core genes, furthermoee 11 core-candiate genes and altogether 25 curated genes according to the clinical signs

ID
PP0930
Number of genes
18 Accredited laboratory test
Examined sequence length
16,9 kb (Core-/Core-canditate-Genes)
29,8 kb (Extended panel: incl. additional genes)
Analysis Duration
on request
Material
  • EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
Diagnostic indications

NGS +

[Sanger]

 

Gene panel

Selected genes

NameExon Length (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Heredity
AIP993NM_003977.4AD
CDC731596NM_024529.5AD
CDKN1B597NM_004064.5AD, Sus
MAX483NM_002382.5AD, Sus
MEN11833NM_130799.2AD, Sus
PRKAR1A1146NM_002734.5AD
RET3345NM_020975.6AD, Sus
SDHA1995NM_004168.4AD, AR
SDHAF2501NM_017841.4AD
SDHB843NM_003000.3AD
SDHC510NM_003001.5AD
SDHD480NM_003002.4AD
TMEM127717NM_017849.4AD, Sus
TP531182NM_000546.6AD
VHL642NM_000551.4AD, Sus
CASR3237NM_000388.4AD
NF18457NM_001042492.3AD
PTEN1212NM_000314.8AD

Informations about the disease

Clinical Comment

Multiple endocrine neoplasms (MEN) are a group of diseases affecting the hormone-producing glands. In MEN, neoplasms typically occur in at least two endocrine glands; tumors may also develop in other organs and tissues. These growths may be benign or malignant. The major forms are referred to as MEN types 1, 2, and 4. These types differ in the genes involved, the type of hormones produced and the characteristic signs and symptoms. Type 1 often involves tumors of the parathyroid glands, pituitary gland and pancreas, causing overproduction of hormones and leading to hyperparathyroidism with kidney stones, osteoporosis, hypertension and weakness. Type 2 includes medullary thyroid carcinoma and eventually pheochromocytoma with pernicious hypertension. Type 2 is divided into subtypes 2A, 2B and familial medullary thyroid carcinoma. The subtypes differ in their characteristic signs and risk for specific tumors. Within a family, symptoms are relatively uniform. Type 4 has similar symptoms to type 1, but it is caused by mutations in a different gene, with hyperparathyroidism being the most common feature, followed by tumors of the pituitary, other endocrine glands and other organs. Mutations in the MEN1, RET and CDKN1B genes can cause types 1, 2 and 4 usually have autosomal dominant inheritance. A few cases are due to novel mutations in the respective genes. The genetic differential diagnosis of multiple endocrine tumors includes an even broader spectrum of quite different genes compared with MEN usually also with autosomal dominant inheritance. The DNA diagnostic yield using this panel depends on the tumor entities and is still unknown in total. Therefore, an inconspicuous genetic finding does not imply exclusion of the suspected clinical diagnosis.

References: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1257/

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1538/

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1548/

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK97965/

 

Synonyms
  • Alias: Adenomatosis, familial endocrine
  • Alias: Endocrine neoplasia, multiple
  • Alias: Familial endocrine adenomatosis
  • Alias: MEN
  • Alias: Multiple endocrine adenomatosis
  • Alias: Multiple endocrine neoplasms
  • Allelic: Acrodysostosis 1, with/-out hormone resistance (PRKAR1A)
  • Allelic: Angiofibroma, somatic (MEN1)
  • Allelic: Basal cell carcinoma 7 (TP53)
  • Allelic: Bone marrow failure syndrome 5 (TP53)
  • Allelic: Breast cancer, somatic (TP53)
  • Allelic: Cardiomyopathy, dilated, 1GG (SDHA)
  • Allelic: Central hypoventilation syndrome, congenital (RET)
  • Allelic: Choroid plexus papilloma (TP53)
  • Allelic: Colorectal cancer (TP53)
  • Allelic: Deafness, AR 12 (CDH23)
  • Allelic: Epilepsy idiopathic generalized, susceptibility to (CASR)
  • Allelic: Erythrocytosis, familial, 2 (VHL)
  • Allelic: Gastrointestinal stromal tumor (SDHB, SDHC)
  • Allelic: Glioma susceptibility 1 (TP53)
  • Allelic: Glioma susceptibility 2 (PTEN)
  • Allelic: Hemangioblastoma, cerebellar, somatic (VHL)
  • Allelic: Hepatocellular carcinoma, somatic (TP53)
  • Allelic: Hirschsprung disease, protection against + susceptibility to, 1 (RET)
  • Allelic: Hypocalcemia, AD (CASR)
  • Allelic: Hypocalcemia, AD, with Bartter syndrome (CASR)
  • Allelic: Hypocalciuric hypercalcemia, type I (CASR)
  • Allelic: Leigh syndrome (SDHA)
  • Allelic: Leukemia, juvenile myelomonocytic (NF1)
  • Allelic: Lipoma, somatic (MEN1)
  • Allelic: Macrocephaly
  • Allelic: Meningioma (PTEN)
  • Allelic: Mitochondrial respiratory chain complex II deficiency (SDHA, SDHD)
  • Allelic: Myxoma, intracardiac (PRKAR1A)
  • Allelic: Nasopharyngeal carcinoma, somatic (TP53)
  • Allelic: Osteosarcoma (TP53)
  • Allelic: Pancreatic cancer, somatic (TP53)
  • Allelic: Renal cell carcinoma {disease} [MONDO:0005086, panelapp] (CDKN2B)
  • Allelic: Renal cell carcinoma, somatic (VHL)
  • Allelic: Usher syndrome, type 1D (CDH23)
  • Allelic: Usher syndrome, type 1D/F digenic (CDH23)
  • Allelic: Watson syndrome (NF1)
  • Adrenal adenoma, somatic (MEN1)
  • Adrenocortical carcinoma, pediatric (TP53)
  • Adrenocortical tumor, somatic (PRKAR1A)
  • Autism syndrome (PTEN)
  • Carcinoid tumor of lung (MEN1)
  • Carney complex, type 1 (PRKAR1A)
  • Cowden syndrome 1 (PTEN)
  • Fumarase deficiency (FH)
  • Hyperparathyroidism, familial primary (CDC73)
  • Hyperparathyroidism, neonatal (CASR)
  • Hyperparathyroidism-jaw tumor syndrome (CDC73)
  • Leiomyomatosis + renal cell cancer (FH)
  • Lhermitte-Duclos syndrome (PTEN)
  • Li-Fraumeni syndrome (TP53)
  • Medullary thyroid carcinoma (RET)
  • Multiple endocrine neoplasia 1 [panelapp] (CDKN1A, CDKN2B, CDKN2C)
  • Multiple endocrine neoplasia I (MEN1)
  • Multiple endocrine neoplasia IIA + IIB (RET)
  • Multiple endocrine neoplasia IV (CDKN1B)
  • Neuroendocrine cancer [panelapp] (FH)
  • Neurofibromatosis, familial spinal (NF1)
  • Neurofibromatosis, type 1 (NF1)
  • Neurofibromatosis-Noonan syndrome (NF1)
  • Paraganglioma + gastric stromal sarcoma (SDHB, SDHC, SDHD)
  • Paragangliomas 1, with/-out deafness (SDHD)
  • Paragangliomas 2 (SDHAF2)
  • Paragangliomas 3 (SDHC)
  • Paragangliomas 4 (SDHB)
  • Paragangliomas 5 (SDHA)
  • Parathyroid adenoma with cystic changes (CDC73)
  • Parathyroid adenoma, somatic (MEN1)
  • Parathyroid carcinoma (CDC73)
  • Pheochromocytoma (RET, SDHB, SDHD, VHL)
  • Pheochromocytoma, susceptibility to (MAX, TMEM127)
  • Pigmented nodular adrenocortical disease, primary, 1 (PRKAR1A)
  • Pituitary adenoma 1, multiple types (AIP)
  • Pituitary adenoma 2, GH-secreting (GPR101)
  • Pituitary adenoma 5, multiple types (CDH23)
  • Pituitary adenoma predisposition (AIP)
  • Von Hippel-Lindau syndrome (VHL)
  • Zollinger-Ellison syndrome (RPRG1A, CDKN1B)
Heredity, heredity patterns etc.
  • AD
  • AR
  • Sus
OMIM-Ps
  • Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatics and clinical interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboratory requirement

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.