IllnessMikrozephalie mit Lissenzephalie, dünner Kortex

Summary

Short information

Comprehensive differential diagnostic panel for Microcephaly + lissencephaly [thin cortex] comprising 2 guideline-curated genes as well as another curated gene

MP1222

Number of loci

Locus type	Count
Gen	2

Accredited laboratory test

Examined sequence length

10,4 kb (Core-/Core-canditate-Genes)
11,4 kb (Extended panel: incl. additional genes)

Analysis Duration

on request

Test material

EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)

Diagnostic indications

NGS +

Loci

Gen

Name	Exon Length (bp)	OMIM-G	Referenz-Seq.	Heredity
RELN	10383	600514	NM_005045.4	AR
NDE1	1008	609449	NM_001143979.2	AR

Informations about the disease

Clinical Comment

ORPHA452: X-linked lissencephaly with abnormal genitalia

ORPHA89844: Lissencephaly syndrome, Norman-Roberts type: lissencephaly type I with craniofacial anomalies (severe microcephaly, low sloping forehead, broad, prominent nasal bridge, widely set eyes), postnatal growth retardation

Synonyms

Allelic: Epileptic encephalopathy, early infantile, 1 (ARX)
Allelic: Hydranencephaly with abnormal genitalia (ARX)
Allelic: Mental retardation, X-linked 29 + others (ARX)
Allelic: Microhydranencephaly (NDE1)
Allelic: Partington syndrome (ARX)
Allelic: Proud syndrome (ARX)
Epilepsy, familial temporal lobe, 7 (RELN)
Lissencephaly 2, Norman-Roberts type (RELN)
Lissencephaly 4, with microcephaly (NDE1)
Lissencephaly, X-linked 2 (ARX)

Heredity, heredity patterns etc.

OMIM-Ps

Multiple OMIM-Ps

ICD10 Code

Bioinformatics and clinical interpretation

Test-Stärken

DAkkS-akkreditiertes Labor
EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
Gen-Konversionen
komplexe Inversionen
Balancierte Translokationen
Mitochondriale Varianten
Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
niedriger Mosaik-Status
Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
Varianten innerhalb von Pseudogenen
die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboratory requirement

Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.