Deutsch
IllnessMeckel[-Gruber] syndrome, differential diagnosis
Summary
Comprehensive differential diagnostic panel for Meckel[-Gruber] syndrome comprising 10 core candidate genes and altogether 22 curated genes according to the clinical signs
| Locus type | Count |
|---|---|
| Gen | 20 |
47,6 kb (Extended panel: incl. additional genes)
- EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
NGS +
Loci
Gen
| Name | Exon Length (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Heredity |
|---|---|---|---|---|
| B9D1 | 615 | NM_015681.5 | AR | |
| B9D2 | 528 | NM_030578.4 | AR | |
| CC2D2A | 4863 | NM_001080522.2 | AR | |
| CEP290 | 7440 | NM_025114.4 | AR | |
| MKS1 | 1680 | NM_017777.4 | AR | |
| RPGRIP1L | 3948 | NM_015272.5 | AR | |
| TCTN2 | 2094 | NM_024809.5 | AR | |
| TMEM216 | 438 | NM_001173990.3 | AR | |
| TMEM231 | 1110 | NM_001077416.2 | AR | |
| TMEM67 | 2988 | NM_153704.6 | AR | |
| CEP120 | 2961 | NM_153223.4 | AR | |
| CEP41 | 1122 | NM_018718.3 | AR | |
| CSPP1 | 3666 | NM_024790.6 | AR | |
| KIF14 | 4947 | NM_014875.3 | AR | |
| NPHP3 | 3993 | NM_153240.5 | AR | |
| TCTN3 | 1824 | NM_015631.6 | AR | |
| TMEM107 | 514 | NM_032354.5 | AR | |
| TMEM138 | 489 | NM_016464.5 | AR | |
| TMEM237 | 1227 | NM_001044385.3 | AR | |
| TXNDC15 | 1088 | NM_024715.4 | AR |
Informations about the disease
Lethal, multiple congenital anomaly disorder with a triad of brain malformation (mainly occipital encephalocele), large polycystic kidneys + polydactyly, associated abnormalities like cleft lip/palate, cardiac + genital anomalies, central nervous system malformations, liver fibrosis, bone dysplasia
- Alias: Dysencephalia splanchnocystica
- Allelic: Bardet-Biedl syndrome 13 (MKS1)
- Allelic: Bardet-Biedl syndrome 14 (CEP290)
- Allelic: Bardet-Biedl syndrome 14, modifier of (TMEM67)
- Allelic: Bardet-Biedl syndrome 15 (WDPCP)
- Allelic: COACH syndrome (CC2D2A, RPGRIP1L, TMEM67)
- Allelic: Congenital heart defects, hamartomas of tongue + polysyndactyly (WDPCP)
- Allelic: Leber congenital amaurosis 10 (CEP290)
- Allelic: Microcephaly 20, primary, AR (KIF14)
- Allelic: Nephronophthisis 11 (TMEM67)
- Allelic: Nephronophthisis 3 (NPHP3)
- Allelic: RHYNS syndrome (TMEM67)
- Allelic: Renal-hepatic-pancreatic dysplasia 1 (NPHP3)
- Allelic: Senior-Loken syndrome 6 (CEP290)
- Allelic: Short-rib thoracic dysplasia 13 with/-out polydactyly (CEP120)
- Joubert syndrome 14 (TMEM237)
- Joubert syndrome 15 (CEP41)
- Joubert syndrome 16 (TMEM138)
- Joubert syndrome 17 (CPLANE1)
- Joubert syndrome 18 (TCTN3)
- Joubert syndrome 2 (TMEM216)
- Joubert syndrome 20 (TMEM231)
- Joubert syndrome 21 (CSPP1)
- Joubert syndrome 24 (TCTN2)
- Joubert syndrome 28 (MKS1)
- Joubert syndrome 29 (TMEM107)
- Joubert syndrome 31 (CEP120)
- Joubert syndrome 34 (B9D2)
- Joubert syndrome 5 (CEP290)
- Joubert syndrome 6 (TMEM67)
- Joubert syndrome 7 (RPGRIP1L)
- Joubert syndrome 9 (CC2D2A)
- Meckel syndrome 1 (MKS1)
- Meckel syndrome 10 (B9D2)
- Meckel syndrome 11 (TMEM231)
- Meckel syndrome 12 (KIF14)
- Meckel syndrome 13 (TMEM107)
- Meckel syndrome 2 (TMEM216)
- Meckel syndrome 3 (TMEM67)
- Meckel syndrome 4 (CEP290)
- Meckel syndrome 5 (RPGRIP1L)
- Meckel syndrome 6 (CC2D2A)
- Meckel syndrome 7 (NPHP3)
- Meckel syndrome 8 (TCTN2)
- Meckel syndrome 9 (B9D1)
- Meckel[-Gruber] syndrome [panelapp] (TXNDC15)
- Meckel[-Gruber] syndrome [panelapp] (WDPCP)
- Orofaciodigital syndrome IV (TCTN3)
- Orofaciodigital syndrome VI (CPLANE1)
- Orofaciodigital syndrome XVI (TMEM107)
- AR
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatics and clinical interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboratory requirement
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.