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Interdisciplinary CompetenceMolecular Diagnostics
Know how in the analysis of genetic material.
For the benefit of patients.

IllnessGlomerulonephritis, membranoproliferative; differential diagnosis

Summary

Short information

Comprehensive differential diagnostic panel for membranoproliferative glomerulonephritis comprising 10 guideline-curated core genes and altogether 15 curated genes according to the clinical signs

ID
MP0870
Number of genes
15 Accredited laboratory test
Examined sequence length
21,9 kb (Core-/Core-canditate-Genes)
30,1 kb (Extended panel: incl. additional genes)
Analysis Duration
on request
Material
  • EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
Diagnostic indications

NGS +

 

Gene panel

Selected genes

NameExon Length (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Heredity
C34992NM_000064.4AD
CD461179NM_002389.4AD, AR
CFB2295NM_001710.6AD
CFH3696NM_000186.4AR
CFHR1993NM_002113.3AD, AR
CFHR2813NM_005666.4AD
CFHR3993NM_021023.6AD, AR
CFHR41737NM_001201550.3AD
CFHR51710NM_030787.4AD
CFI1752NM_000204.5AR, AD
DGKE1704NM_003647.3AR
ADAMTS134284NM_139025.5AR
LCAT1323NM_000229.2AR
MMACHC849NM_015506.3AR
THBD1728NM_000361.3AD

Informations about the disease

Clinical Comment

Membranoproliferative or mesangiocapillary glomerulonephritis (MPGN) was primarily a (light or electron) microscopic diagnosis, which is now supplemented by integrated information from clinic, serology and genetics. MPGN I is characterized by immune complexes with poly- or monoclonal IgG antibodies; MPGN II is complement-mediated glomerulonephritis. Type II is now referred to as C3 glomerulopathy (C3GP). The onset od C3GP is characterized by micro- or macroscopic hematuria, proteinuria and progressive renal function impairment. Renal function impairment is more common in adults and the elderly. These clinical manifestations are common to all three subtypes of C3GP ("dense deposits disease" DDD; C3 glomerulonephritis, CFHR5 glomerulopathy) based on aberrant control of the alternative complement pathway and sequential deposition of C3 in the glomeruli. DDD onset is characterized by either nephrotic or acute nephritic syndrome. Hypertension may be present at onset or later. In a few cases, DDD shows drusen at the fundus oculi, and some patients may have partial lipodystrophy as in MPGN. Diseases from this group are inherited either autosomal recessively or dominantly. The molecular genetic yield is little over 20% in these very rare conditions. A negative molecular genetic result does not constitute exclusion of the clinical diagnosis.

References: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1425/

 

Synonyms
  • Alias: Mesangiocapillary glomerulonephritis; MPGN
  • Allelic: Basal laminar drusen (CFH)
  • Allelic: C3 deficiency (C3)
  • Allelic: Complement factor B deficiency (CFB)
  • Allelic: Complement factor H deficiency (CFH)
  • Allelic: Fish-eye disease (LCAT)
  • Allelic: Macular degeneration, age-related, 14, reduced risk of (CFB)
  • Allelic: Macular degeneration, age-related, 4 (CFH)
  • Allelic: Macular degeneration, age-related, 9 (C3)
  • Allelic: Macular degeneration, age-related, reduced risk of (CFHR1, CFHR2, CFHR3, CFHR4)
  • Allelic: Macular degeneration, age-related, reduced risk of (CFHR3)
  • Allelic: Thrombophilia due to thrombomodulin defect (THBD)
  • C3 glomerulopathy (CFHR2, CFI)
  • Complement factor D deficiency (CFD)
  • Hemolytic uremic syndrome, atypical, susceptibility to (CFHR1, CFHR2, CFHR3, CFHR4)
  • Hemolytic uremic syndrome, atypical, susceptibility to, 1 (CFH)
  • Hemolytic uremic syndrome, atypical, susceptibility to, 2 (CD46)
  • Hemolytic uremic syndrome, atypical, susceptibility to, 3 (CFI)
  • Hemolytic uremic syndrome, atypical, susceptibility to, 4 (CFB)
  • Hemolytic uremic syndrome, atypical, susceptibility to, 5 (C3)
  • Hemolytic uremic syndrome, atypical, susceptibility to, 6 (THBD)
  • Hemolytic uremic syndrome, atypical, susceptibility to, 7 (DGKE)
  • Immune-complex-mediated MPGN (CFHR2, CFI)
  • Methylmalonic aciduria and homocystinuria, cblC type (MMACHC)
  • Nephropathy due to CFHR5 deficiency (CFHR5)
  • Nephrotic syndrome, type 7 (DGKE)
  • Norum disease (LCAT)
  • Thrombotic thrombocytopenic purpura, hereditary (ADAMTS13)
Heredity, heredity patterns etc.
  • AD
  • AR
OMIM-Ps
  • Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatics and clinical interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboratory requirement

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.