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IllnessGlomerulonephritis, focal segmental; differential diagnosis
Summary
Comprehensive differential diagnostic panel for focal segmental glomerulonephritis comprising 8 and altogether 36 curated genes according to the clinical signs
38,9 kb (Extended panel: incl. additional genes)
- EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
NGS +
Gene panel
Selected genes
| Name | Exon Length (bp) | OMIM-G | Referenz-Seq. | Heredity |
|---|---|---|---|---|
| ACTN4 | 2736 | NM_004924.6 | AD | |
| ANLN | 3375 | NM_018685.5 | AD | |
| CD2AP | 1920 | NM_012120.3 | n.k. | |
| CRB2 | 3858 | NM_173689.7 | AR | |
| INF2 | 3750 | NM_022489.4 | AD | |
| MYO1E | 3327 | NM_004998.4 | AR | |
| PAX2 | 1254 | NM_003987.5 | AD | |
| TRPC6 | 2796 | NM_004621.6 | AD | |
| APOL1 | 1197 | NM_001136540.2 | AR, Sus | |
| GLA | 1290 | NM_000169.3 | XL | |
| NPHS1 | 3726 | NM_004646.4 | AR | |
| NPHS2 | 1152 | NM_014625.4 | AR | |
| PLCE1 | 6909 | NM_016341.4 | AR | |
| WT1 | 1569 | NM_024426.6 | AD |
Informations about the disease
A pathologic finding in several renal disorders manifesting clinically as proteinuria + progressive renal dysfunction. Some patients develop nephrotic syndrome, which includes massive proteinuria, hypoalbuminemia, hyperlipidemia, edema. FSGS patients may have proteinuria in the nephrotic range without other features of nephrotic syndrome.
- Allelic: Brain small vessel disease 2 (COL4A2)
- Allelic: Cystinosis, ocular nonnephropathic (CTNS)
- Allelic: Deafness, XL 6 (COL4A6)
- Allelic: Denys-Drash syndrome (WT1)
- Allelic: Fabry disease, cardiac variant (GLA)
- Allelic: Frasier syndrome (WT1)
- Allelic: Meacham syndrome (WT1)
- Allelic: Mesothelioma, somatic (WT1)
- Allelic: Nail-patella syndrome (LMX1B)
- Allelic: Ovarian dysgenesis 6 (NUP107)
- Allelic: Palmoplantar keratoderma woolly hair (KANK2)
- Allelic: Short-rib thoracic dysplasia 4 with/-out polydactyly (TTC21B)
- Allelic: Wilms tumor, type 1 (WT1)
- Alport syndrome 1, XL (COL4A5)
- Alport syndrome 2, AR (COL4A3, COL4A4)
- Alport syndrome 3, AD (COL4A3)
- Angiopathy, hereditary, with nephropathy, aneurysms + muscle cramps (COL4A1)
- Cystinosis, atypical nephropathic (CTNS)
- Cystinosis, late-onset juvenile or adolescent nephropathic (CTNS)
- Cystinosis, nephropathic (CTNS)
- Fabry disease (GLA)
- Focal segmental glomerulosclerosis + neurodevelopmental syndrome (TRIM8)
- Focal segmental glomerulosclerosis 10 (LMX1B)
- Focal segmental glomerulosclerosis 8 (ANLN)
- Focal segmental glomerulosclerosis 9 (CRB2)
- Galloway-Mowat syndrome 7 (NUP107)
- Glomerulosclerosis, focal segmental 1 (ACTN4)
- Glomerulosclerosis, focal segmental 2 (TRPC6)
- Glomerulosclerosis, focal segmental 3 (CD2AP)
- Glomerulosclerosis, focal segmental 4, susceptibility to (APOL1)
- Glomerulosclerosis, focal segmental 5 (INF2)
- Glomerulosclerosis, focal segmental 6 (MYO1E)
- Glomerulosclerosis, focal segmental 7 (PAX2)
- Hematuria, benign familial (COL4A3, COL4A4)
- Nephronophthisis 12 (TTC21B)
- Nephrotic syndrome, type 1 (NPHS1)
- Nephrotic syndrome, type 10 (EMP2)
- Nephrotic syndrome, type 11 (NUP107)
- Nephrotic syndrome, type 12 (NUP93)
- Nephrotic syndrome, type 13 (NUP205)
- Nephrotic syndrome, type 15 (MAGI2)
- Nephrotic syndrome, type 16 (KANK2)
- Nephrotic syndrome, type 2 (NPHS2)
- Nephrotic syndrome, type 3 (PLCE1)
- Nephrotic syndrome, type 4 (WT1)
- Nephrotic syndrome, type 6 (PTPRO)
- Nephrotic syndrome, type 8 (ARHGDIA)
- AD
- AR
- Sus
- XL
- n.k.
- Multiple OMIM-Ps
Bioinformatics and clinical interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboratory requirement
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.