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Interdisciplinary CompetenceMolecular Diagnostics
Know how in the analysis of genetic material.
For the benefit of patients.

IllnessEpilepsy, progressive myoclonic; differentiaöl diagnosis

Summary

Short information

Comprehensive differential diagnostic panel for Epilepsy, progressive myoclonic comprising 14 or 32 curated genes according to the clinical signs

ID
EP0372
Number of genes
24 Accredited laboratory test
Examined sequence length
20,1 kb (Core-/Core-canditate-Genes)
41,2 kb (Extended panel: incl. additional genes)
Analysis Duration
on request
Material
  • EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
Diagnostic indications

NGS +

CSTB gene: often 12mer repeat [(CCCCGCCCCGCG)n] expansion

 

Gene panel

Selected genes

NameExon Length (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Heredity
AMT1212NM_000481.4AR
EPM2A996NM_005670.4AR
FOLR1774NM_016725.3AR
GLDC3063NM_000170.3AR
GOSR2639NM_004287.5AR
KCNC11758NM_001112741.2AD
KCTD7870NM_153033.5AR
LMNB21863NM_032737.4AR
NEU11248NM_000434.4AR
NHLRC11188NM_198586.3AR
PRICKLE12496NM_153026.3AR
PRICKLE22535NM_198859.4AR
SCARB21437NM_005506.4AR
ASAH11188NM_177924.5AR
CACNB41563NM_000726.5AD
CERS11064NM_021267.5AR
CUX24461NM_015267.4AD
D2HGDH1566NM_152783.5AR
GABRA11371NM_000806.5AD
GBA11611NM_001005741.3AR
PRDM82078NM_001099403.2AR
SEMA6B2701NM_032108.4AD
SLC6A11800NM_003042.4AD
TBC1D241680NM_001199107.2AR

Informations about the disease

Clinical Comment

Patients with progressive myoclonus, Unverricht-Lundborg, epilepsy (EPM1) show initial symptoms at 6-15 years of age with increasingly frequent episodes of myoclonus that, for example, progressively interfere with walking. In the further progression, ataxia, dysarthria, intention tremor, depression and intellectual decline may develop. Depending on the severity of the disease and response to treatment, life expectancy may be normal. EPM1 diagnosis is frequently (90%) made by biallelic elongated CCC CGC CCC GCG (dodecamer) expansions in the CSTB gene or compound heterozygosity for a CSTB dodecamer expansion and a CSTB mutation (10%). 2-3 dodecamer repeats are normal alleles, indeterminate diagnostic significance have alleles comprising 12-17 dodecamer repeats (unstable but not clinically confirmed). Pathogenic are ≥30 dodecamer repeats which exhibit full penetrance. The diagnostic yield has been infrequently described at <70%. Inconspicuous findings exclude by no means the clinical diagnosis.

References: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1142/

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1389/

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK488189/

 

Synonyms
  • Allelic: Deafness, AD 65 (TBC1D24)
  • Allelic: Deafness, Ar 86 (TBC1D24)
  • Allelic: Epilepsy, childhood absence, susceptibility to, 4 (GABRA2)
  • Allelic: Epilepsy, idiopathic generalized, 10 (GABRD)
  • Allelic: Epilepsy, idiopathic generalized, susceptibility to, 9 (CACNB4)
  • Allelic: Epilepsy, juvenile absence, susceptibility to, 1 (EFHC1)
  • Allelic: Episodic ataxia, type 5 (CACNB4)
  • Allelic: Farber lipogranulomatosis (ASAH1)
  • Allelic: Generalized epilepsy with febrile seizures plus, type 5, susceptibility to (GABRD)
  • Allelic: Lipodystrophy, partial, acquired, susceptibility to (LMNB2)
  • Cherry red spot-myoclonus syndrome (NEU1)
  • DOORS [deafness, onychodystrophy, osteodystrophy, mental retardation, seizures] syndrome (TBC1D24)
  • Epilepsy, familial adult myoclonic, 2 (STARD7)
  • Epilepsy, juvenile myoclonic, susceptibility to (GABRD)
  • Epilepsy, juvenile myoclonic, susceptibility to, 5 (GABRA2)
  • Epilepsy, juvenile myoclonic, susceptibility to, 6 (CACNB4)
  • Epilepsy, progressive myoclonic 1A, Unverricht/Lundborg (AMT, CSTB)
  • Epilepsy, progressive myoclonic 1B (PRICKLE1)
  • Epilepsy, progressive myoclonic 2A, Lafora (EPM2A)
  • Epilepsy, progressive myoclonic 2B, Lafora (NHLRC1)
  • Epilepsy, progressive myoclonic 3, with/-out intracellular inclusions (KCTD7)
  • Epilepsy, progressive myoclonic 4, with or without renal failure (SCARB2)
  • Epilepsy, progressive myoclonic 6 (GOSR2)
  • Epilepsy, progressive myoclonic 7 (KCNC1)
  • Epilepsy, progressive myoclonic, 10 (PRDM8)
  • Epilepsy, progressive myoclonic, 11 (SEMA6B)
  • Epilepsy, progressive myoclonic, 8 (CERS1)
  • Epilepsy, progressive myoclonic, 9 (LMNB2)
  • Epilepsy, rolandic, with proxysmal exercise-induce dystonia and writer's cramp (TBC1D24)
  • Epileptic encephalopathy, early infantile, 16 (TBC1D24)
  • Epileptic encephalopathy, early infantile, 19 (GABRA2)
  • Epileptic encephalopathy, early infantile, 67 (CUX2)
  • Glycine encephalopathy (GLDC)
  • Infantile onset myoclonic epileptic encephalopathy (CUX2)
  • Lipomucopolysaccharidosis (NEU1)
  • Mucolipidosis I (NEU1)
  • Myoclonic atonic seizures [panelapp] (SYNCRIP)
  • Myoclonic epilepsy + intellectual disability [panelapp] (CSNK2B)
  • Myoclonic epilepsy, infantile, familial (TBC1D24)
  • Myoclonic epilepsy, juvenile, susceptibility to, 1 (EFHC1)
  • Myoclonic seizures [panelapp] (GRIA2)
  • Myoclonic-atonic epilepsy (SLC6A1)
  • Neurodevelopmental disorder with language impairment and behavioral abnormalities (GRIA2)
  • Poirier-Bienvenu neurodevelopmental syndrome: early-onset seizures + ID (CSNK2B)
  • Sandhoff disease, infantile, juvenile + adult forms (HEXB)
  • Sialidosis, type I-II (NEU1)
  • Spinal muscular atrophy with progressive myoclonic epilepsy (ASAH1)
Heredity, heredity patterns etc.
  • AD
  • AR
OMIM-Ps
  • Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatics and clinical interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboratory requirement

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.