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Interdisciplinary CompetenceMolecular Diagnostics
Know how in the analysis of genetic material.
For the benefit of patients.

IllnessAtaxia, episodic; differential diagnosis

Summary

Short information

Comprehensive differential diagnostic panel for episodic ataxia comprising 2 guideline-curated and another 8 curated genes according to the clinical signs

ID
AP2938
Number of genes
10 Accredited laboratory test
Examined sequence length
14,6 kb (Core-/Core-canditate-Genes)
38,5 kb (Extended panel: incl. additional genes)
Analysis Duration
on request
Material
  • EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
Diagnostic indications

NGS +

 

Gene panel

Selected genes

NameExon Length (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Heredity
ATP1A33042NM_152296.5AD
CACNA1A6786NM_001127221.2AD, AR
CACNB41563NM_000726.5AD
KCNA11488NM_000217.3AD
SLC1A31629NM_004172.5AD
PNKD429NM_015488.5AD
PRRT21023NM_145239.3AD
SCN2A6018NM_021007.3AD
UBR416112NM_020765.3AD
VAMP1357NM_014231.5AD

Informations about the disease

Clinical Comment

Episodic ataxia refers to a group of related disorders that result in recurrent episodes of incoordination and ataxia. During these episodes, many patients also suffer from dizziness, nausea/vomiting, migraines, blurred or double vision, slurred speech and tinnitus. Seizures and hemiplegia may also occur during the episodes. In addition, some patients experience myokymia during or between seizures, with muscle spasms, stiffness and continuous fine muscle twitching/spasms under the skin. Ataxia episodes and the other symptoms can occur from early childhood into adulthood. They can be triggered by emotional stress, caffeine, alcohol, certain medications, physical activity and illness. The frequency of episodes ranges from several per episode to 1-2/year. Between episodes, some sufferers continue to experience ataxia, which can worsen over time, as well as additional nystagmus. There are at least 7 types of episodic ataxia, distinguished by symptoms, age of onset, duration of attacks and, if known, their genetic basis. Episodic ataxia can be caused by mutations in several genes, e.g. KCNA1, CACNA1A and CACNB4 as channel disorders relating to episodic ataxia types 1, 2 and 5, respectively. Mutations in the SLC1A3 gene are the cause of episodic ataxia type 6, a neurotransmitter disorder. In these 4 types, certain neurons become overexcited and disrupt normal communication between cells. The genetics for some of the other forms of episodic ataxia have not yet been worked out. Episodic ataxia is inherited in an autosomal dominant manner. As the molecular genetic yield rarely exceeds 60% of cases, a negative DNA test result does not exclude the clinical diagnosis.

References: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK25442/

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1388/

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1138/

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK475803/

 

Synonyms
  • Alias: Hereditary episodic ataxia
  • Allelic: Alternating hemiplegia of childhood 2; Dystonia-12 (ATP1A3)
  • Allelic: Catastrophic epilepsy, unusual apnea spells + postnatal microcephaly (ATP1A3)
  • Allelic: Rapid-onset dystonia-parkinsonism (ATP1A3)
  • Acetazolamide-responsive hereditary paroxysmal cerebellar ataxia (CACNA1A)
  • Allelic: Convulsions, familial infantile, with paroxysmal choreoathetosis (PRRT2)
  • Allelic: Developmental + epileptic encephalopathy 11 (SCN2A)
  • Allelic: Myasthenic syndrome, congenital, 25 (VAMP1)
  • Allelic: Seizures, benign familial infantile, 2 (PRRT2)
  • Allelic: Seizures, benign familial infantile, 3 (SCN2A)
  • CACNA1A-related episodic ataxia type 2 (CACNA1A)
  • Cerebellar ataxia, areflexia, pes cavus, optic atrophy, sensorineural hearing loss, CAPOS (ATP1A3)
  • Epilepsy, juvenile myoclonic, 6 (CACNB4)
  • Episodic ataxia [panelapp] (UBR4)
  • Episodic ataxia, nystagmus-associated (CACNA1A)
  • Episodic ataxia, type 1 (KCNA1)
  • Episodic ataxia, type 2, EA2 (CACNA1A)
  • Episodic ataxia, type 5 (CACNB4)
  • Episodic ataxia, type 6 (SLC1A3)
  • Episodic ataxia, type 9 (SCN2A)
  • Episodic ataxia-8 [OMIM preliminary designation] (UBR4)
  • Episodic ataxia/myokymia syndrome (KCNA1)
  • Episodic kinesigenic dyskinesia 1 (PRRT2)
  • Hypomagnesemia, AD (KCNA1)
  • Migraine familial hemiplegic 1 (CACNA1A)
  • Migraine, familial hemiplegic, 1, with progressive cerebellar ataxia (CACNA1A)
  • Myokymia with periodic ataxia (KCNA1)
  • Paroxysmal nonkinesigenic dyskinesia 1 (PNKD)
  • Spastic ataxia 1, AD (VAMP1)
  • Spinocerebellar ataxia 6 (CACNA1A)
  • Susceptibility to epilepsy, idiopathic generalized, 9 (CACNB4)
Heredity, heredity patterns etc.
  • AD
  • AR
OMIM-Ps
  • Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatics and clinical interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboratory requirement

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.