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IllnessSpondyloepiphyseal dysplasia, differential diagnosis
Summary
Short information
Comprehensive differential diagnostic panel for Spondyloepiphyseal Dysplasia comprising 1 guideline-curated gene and altogether 18 curated genes according to the clinical signs
ID
SP1029
Number of loci
| Locus type | Count |
|---|---|
| Gen | 8 |
Examined sequence length
17,7 kb (Core-/Core-canditate-Genes)
21,0 kb (Extended panel: incl. additional genes)
21,0 kb (Extended panel: incl. additional genes)
Analysis Duration
on request
Test material
- EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
Diagnostic indications
NGS +
Loci
Informations about the disease
Clinical Comment
No ORPHA#: large group of diseases
Synonyms
- Spondyloepiphyseal dysplasia, sensorineural hearing loss, ID + Leber congenital amaurosis (NMNAT1)
- ?Spondyloepimetaphyseal dysplasia, Di Rocco type (UFSP2)
- Allelic: Autism, susceptibility to, XL 5 (RPL10)
- Allelic: Carpal tunnel syndrome (COMP)
- Allelic: Deafness, AD 13 (COL11A2)
- Allelic: Deafness, AD 37 (COL11A1)
- Allelic: Deafness, AR 53 (COL11A2)
- Allelic: Hereditary motor and sensory neuropathy, type IIc (TRPV4)
- Allelic: Leber congenital amaurosis 9 (NMNAT1)
- Allelic: Legg-Calve-Perthes disease (COL2A1)
- Allelic: Lumbar disc herniation, susceptibility to (COL11A1)
- Allelic: Neuronopathy, distal hereditary motor, type VIII (TRPV4)
- Allelic: Osteoarthritis with mild chondrodysplasia (COL2A1)
- Allelic: Parastremmatic dwarfism (TRPV4)
- Allelic: Schwartz-Jampel syndrome, type 1 (HSPG2)
- Allelic: Short stature, adv. bone age, with/-out early osteoarthritis +/- osteochondr. diss. (ACAN)
- Allelic: Sodium serum level QTL 1 (TRPV4)
- Allelic: Spondyloepimetaphyseal dysplasia, aggrecan type (ACAN)
- Allelic: Stickler sydrome, type I, nonsyndromic ocular (COL2A1)
- Allelic: Stickler syndrome, type I (COL2A1)
- Allelic: Vitreoretinopathy with phalangeal epiphyseal dysplasia (COL2A1)
- Arthropathy, progressive pseudorheumatoid, of childhood (CCN6)
- Avascular necrosis of femoral head, primary, 2 (TRPV4)
- Brachyolmia type 3 (TRPV4)
- Czech dysplasia (COL2A1)
- Digital arthropathy-brachydactyly, familial (TRPV4)
- Dyssegmental dysplasia, Silverman-Handmaker type (HSPG2)
- Epiphyseal dysplasia, multiple, 1 (COMP)
- Epiphyseal dysplasia, multiple, with myopia + deafness (COL2A1)
- Fibrochondrogenesis 1 (COL11A1)
- Fibrochondrogenesis 2 (COL11A2)
- GM1-gangliosidosis, types I, II, III (GLB1)
- Hip dysplasia, Beukes type (UFSP2)
- Intellectual developmental disorder, XL, syndromic, 35 (RPL10)
- Kniest dysplasia (COL2A1)
- Lowry-Wood syndrome (RNA4ATAC)
- Marshall syndrome (COL11A1)
- Metatropic dysplasia (TRPV4)
- Microcephalic osteodysplastic primordial dwarfism, type I (RNA4ATAC)
- Mucopolysaccharidosis IVA (GALNS)
- Mucopolysaccharidosis type IVB, Morquio (GLB1)
- Otospondylomegaepiphyseal dysplasia, AD (COL11A2)
- Otospondylomegaepiphyseal dysplasia, AR (COL11A2)
- Platyspondylic skeletal dysplasia, Torrance type (COL2A1)
- Pseudoachondroplasia (COMP)
- Roifman syndrome (RNA4ATAC)
- Scapuloperoneal spinal muscular atrophy (TRPV4)
- Schimke immunoosseous dysplasia (SMARCAL1)
- Spondyloepimetaphyseal dysplasia Strudwick type (COL2A1)
- Spondyloepiphyseal dysplasia congenita (COL2A1)
- Spondyloepiphyseal dysplasia tarda (TRAPPC2)
- Spondyloepiphyseal dysplasia tarda with progressive arthropathy (CCN6)
- Spondyloepiphyseal dysplasia with congenital joint dislocations (CHST3)
- Spondyloepiphyseal dysplasia, Kimberley type (ACAN)
- Spondyloepiphyseal dysplasia, Kondo-Fu type (MBTPS1)
- Spondyloepiphyseal dysplasia, Maroteaux (TRPV4)
- Spondyloepiphyseal dysplasia, Stanescu type (COL2A1)
- Spondyloepiphyseal dysplasia, sensorineural hearing loss, ID + Leber congenital amaurosis (NMNAT1)
- Spondylometaphyseal dysplasia, Kozlowski type (TRPV4)
- Spondyloperipheral dysplasia (COL2A1)
- Stickler syndrome, type II (COL11A1)
Heredity, heredity patterns etc.
- AD
- AR
- XLR
OMIM-Ps
- Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code
Bioinformatics and clinical interpretation
Test-Stärken
- DAkkS-akkreditiertes Labor
- EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
- Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
- Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
- Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
- eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
- unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
- unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
- unsere umfassenden klinischen Aussagen
Testeinschränkungen
- Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
- Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
- es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
- die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
- Gen-Konversionen
- komplexe Inversionen
- Balancierte Translokationen
- Mitochondriale Varianten
- Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
- nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
- niedriger Mosaik-Status
- Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
- Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
- Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
- Varianten innerhalb von Pseudogenen
- die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde
Laboratory requirement
Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.
Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.
Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.
Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.