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Interdisciplinary CompetenceMolecular Diagnostics
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IllnessMorbus Hirschsprung, syndromic; differential diagnosis

Summary

Short information

Comprehensive differential diagnostic panel for Morbus Hirschsprung, syndromic, comprising 1 guideline-curated core gene, 11 additional core-candidate genes and altogether 49 curated genes according to the clinical signs

ID
MP8463
Number of loci
Locus typeCount
Gen 34
Accredited laboratory test
Examined sequence length
21,5 kb (Core-/Core-canditate-Genes)
79,3 kb (Extended panel: incl. additional genes)
Analysis Duration
on request
Test material
  • EDTA-anticoagulated blood (3-5 ml)
Diagnostic indications

NGS +

[Sanger]

 

Loci

Gen

NameExon Length (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Heredity
ECE12313NM_001397.3AD
EDN3717NM_207034.3AD, AR, Sus
EDNRB1329NM_000115.5AD, AR, Sus
GDNF636NM_000514.4AD
KIFBP1866NM_015634.4AR
L1CAM3774NM_000425.5XLR
PHOX2B945NM_003924.4AD
RET3345NM_020975.6AD
SOX101401NM_006941.4AD
TTC81518NM_198309.3AR
ZEB23645NM_014795.4AD
BBS11782NM_024649.5AR, digenisch
BBS102172NM_024685.4AR
BBS122133NM_152618.3AR
BBS22166NM_031885.5AR
BBS41560NM_033028.5AR
BBS72148NM_176824.3AR
CELSR39974NM_001407.3AD
DENND34626NM_014957.5AD
DHCR71428NM_001360.3AR
GFRA11398NM_005264.8Sus
MKKS1713NM_018848.3AR
MKS11680NM_017777.4AR
NCLN1707NM_020170.4AD
NKX2-11206NM_001079668.3AD
NRG11938NM_013956.5Ass
NRG32091NM_001010848.4Sus
NUP985507NM_005387.7AD
RMRP300NR_003051.4AR
SEMA3C2273NM_006379.5AD
SEMA3D2334NM_152754.3AD
TBATA2160NM_152710.4AD
TCF42016NM_001083962.2AD
VCL3405NM_014000.3AD

Informations about the disease

Clinical Comment

Der Morbus Hirschsprung (Hirschsprung-Krankheit, HSCR) manifestiert sich im Allgemeinen kurz nach der Geburt mit Symptomen eines Darmverschlusses wie fehlendem Mekoniumabgang innerhalb der ersten 48 Lebensstunden, Bauchschmerzen, Verstopfung, fortschreitender Bauchblähung, Erbrechen und gelegentlich Durchfall. In seltenen Fällen zeigt er sich später in der Kindheit mit Symptomen schwerer Verstopfung und Gedeihstörungen. Anhand des Ausmaßes der Aganglionose werden vier Formen der Krankheit unterschieden: Bei der klassischen Form (HSCR; 80 % der Fälle) ist die Aganglionose auf das Rektosigmoid beschränkt. Bei der langsegmentalen HSCR (15 %) erstreckt sich die Aganglionose über das Sigma hinaus, während bei der totalen Colon-Aganglionose (5 %) die Aganglionose den gesamten Dickdarm betrifft. Die totale intestinale Aganglionose ist die schwerste Form und kommt äußerst selten vor. Die Prävalenz der Hirschsprung-Krankheit (HSCR) bei der Geburt wird auf 1/5.000-10.000 geschätzt. Bei der rektosigmoidalen HSCR überwiegt das männliche Geschlecht im Verhältnis 4:1. führt. Die Ätiologie der HSCR ist multifaktoriell. Mehrere Gene sind mit HSCR assoziiert, darunter das RET-Protoonkogen, das Gen des von Gliazellen abgeleiteten neurotrophen Faktors (GDNF), das Endothelin-B-Rezeptor-Gen (EDNRB), das Endothelin-3-Gen (EDN3), und das L1-Zelladhäsionsmolekül-Gen L1CAM. Pathogene Varianten in diesen Suszeptibilitätsgenen werden als autosomal-dominant wirkende Faktoren mit niedriger Penetranz aufgefasst. HSCR kann auch mit Syndromen wie dem neurologischen Waardenburg-Shah-Syndrom, dem Bardet-Biedl-Syndrom, dem Mowat-Wilson-Syndrom, dem Haddad-Syndrom oder dem multiplen endokrinen Neoplasie-Syndrom Typ 2A, dem Goldberg-Shprintzen-Syndrom, dem Smith-Lemli-Opitz-Syndrom, dem Kaufman-McKusick-Syndrom, dem orofazialen digitalen Syndrom Typ 5, dem PCWH-Syndrom, der Knorpel-Haar-Hypoplasie und dem Down-Syndrom assoziiert sein.

Literatur

Orphanet: Hirschsprung disease, https://www.orpha.net/en/disease/detail/388

NIH: Hirschsprung disease, https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK562142/

 

Synonyms
  • Alias: Aganglionic megacolon + other symptoms
  • Alias: Agangliose + other symptoms
  • Alias: Congenital intestinal aganglionosis + other symptoms
  • Allelic: Anauxetic dysplasia 1 (RMRP)
  • Allelic: CRASH syndrome (L1CAM)
  • Allelic: Chorea, hereditary benign (NKX2-1)
  • Allelic: Choreoathetosis, hypothyroidism + neonatal respiratory distress (NKX2-1)
  • Allelic: Corneal dystrophy, Fuchs endothelial, 3 (TCF4)
  • Allelic: Corpus callosum, partial agenesis of (L1CAM)
  • Allelic: Hypertension, essential, susceptibility to (ECE1)
  • Allelic: MASA syndrome (L1CAM)
  • Allelic: McKusick-Kaufman syndrome (MKKS)
  • Allelic: Medullary thyroid carcinoma (RET)
  • Allelic: Metaphyseal dysplasia without hypotrichosis (RMRP)
  • Allelic: Multiple endocrine neoplasia IIA (RET)
  • Allelic: Multiple endocrine neoplasia IIB (RET)
  • Allelic: Neuroblastoma, susceptibility to, 2 (PHOX2B)
  • Allelic: Pheochromocytoma (RET)
  • Allelic: Pheochromocytoma, modifier of (GDNF)
  • Allelic: Retinitis pigmentosa 51 (TTC8)
  • Allelic: Schizophrenia, susceptibility to (NRG1)
  • Allelic: Thyroid cancer, nonmedullary, 1 (NKX2-1)
  • ABCD syndrome (EDNRB)
  • Acrocapitofemoral dysplasia (IHH)
  • Bardet-Biedl syndrome 1 (BBS1, -4, -7, -10, -12)
  • Bardet-Biedl syndrome 13 (MKS1)
  • Bardet-Biedl syndrome 6 (MKKS)
  • Bardet-Biedl syndrome 8 (TTC8)
  • Brachydactyly, type A1 (IHH)
  • Cartilage-hair hypoplasia (RMRP)
  • Central hypoventilation syndrome, congenital, with/-out Hirschsprung disease (PHOX2B)
  • Culler-Jones syndrome (GLI2)
  • Epidermolysis bullosa, junctional 5A, intermediate (ITGB4)
  • Epidermolysis bullosa, junctional 5B, with pyloric atresia (ITGB4)
  • Episodic ataxia type 8 [panelapp?] (UBR4)
  • Glycogen storage disease XIII (ENO3)
  • Goldberg-Shprintzen megacolon syndrome (KIFBP)
  • Greig cephalopolysyndactyly syndrome (GLI3)
  • Hirschsprung disease [panelapp] (CELSR3)
  • Hirschsprung disease, cardiac defects + autonomic dysfunction (ECE1)
  • Hirschsprung disease, protection against (RET)
  • Hirschsprung disease, short-segment aganglionosis (NKX2-1)
  • Hirschsprung disease, susceptibility to [panelapp] (DENND3)
  • Hirschsprung disease, susceptibility to [panelapp] (GFRA1)
  • Hirschsprung disease, susceptibility to [panelapp] (NCLN)
  • Hirschsprung disease, susceptibility to [panelapp] (NRG1)
  • Hirschsprung disease, susceptibility to [panelapp] (NRG3)
  • Hirschsprung disease, susceptibility to [panelapp] (NUP98)
  • Hirschsprung disease, susceptibility to [panelapp] (SEMA3C)
  • Hirschsprung disease, susceptibility to [panelapp] (SEMA3D)
  • Hirschsprung disease, susceptibility to [panelapp] (TBATA)
  • Hirschsprung disease, susceptibility to [panelapp] (VCL)
  • Hirschsprung disease, susceptibility to, 1 (RET)
  • Hirschsprung disease, susceptibility to, 2 (EDNRB)
  • Hirschsprung disease, susceptibility to, 3 (GDNF)
  • Hirschsprung disease, susceptibility to, 4 (EDN3)
  • Hirschsprung disease,HSCR [panelapp] (BACE2)
  • Holoprosencephaly 9 (GLI2)
  • Hydrocephalus due to aqueductal stenosis (L1CAM)
  • Hydrocephalus with Hirschsprung disease (L1CAM)
  • Hydrocephalus with congenital idiopathic intestinal pseudoobstruction (L1CAM)
  • Joubert syndrome 28 (MKS1)
  • Meckel syndrome 1 (MKS1)
  • Mowat-Wilson syndrome (ZEB2)
  • Neuroblastoma with Hirschsprung disease (PHOX2B)
  • PCWH syndrome (SOX10)
  • Pallister-Hall syndrome (GLI3)
  • Pitt-Hopkins syndrome (TCF4)
  • Polydactyly, postaxial, type A8 (GLI1)
  • Polydactyly, postaxial, types A1 + B (GLI3)
  • Polydactyly, preaxial I (GLI1)
  • Polydactyly, preaxial, type IV (GLI3)
  • Short-segment Hirschsprung disease [panelapp] (VCL)
  • Smith-Lemli-Opitz syndrome (DHCR7)
  • Susceptibility to Hirschsprung disease [panelapp] (NRTN)
  • Susceptibility to Hirschsprung disease [panelapp] (PSPN)
  • Visceral neuropathy, familial, 2, AR (ERBB2)
  • Waardenburg syndrome, type 2E, with/-out neurologic involvement (SOX10)
  • Waardenburg syndrome, type 4A (EDNRB)
  • Waardenburg syndrome, type 4B (EDN3)
  • Waardenburg syndrome, type 4C (SOX10)
Heredity, heredity patterns etc.
  • AD
  • AR
  • Ass
  • Sus
  • XLR
  • digenisch
OMIM-Ps
  • Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatics and clinical interpretation

Test-Stärken

  • DAkkS-akkreditiertes Labor
  • EU-Richtlinie für IVD in Umsetzung
  • Qualitäts-kontrolliert arbeitendes Personal
  • Leistungsstarke Sequenzierungstechnologien, fortschrittliche Target-Anreicherungsmethoden und Präzisions-Bioinformatik-Pipelines sorgen für überragende analytische Leistung
  • Sorgfältige Kuratierung klinisch relevanter und wissenschaftlich begründeter Gen-Panels
  • eine Vielzahl nicht Protein-kodierender Varianten, die in unseren klinischen NGS-Tests mit erfasst werden
  • unser strenges Variantenklassifizierungsschema nach ACMG-Kriterien
  • unser systematischer klinischer Interpretations-Workflow mit proprietärer Software ermöglicht die genaue und nachvollziehbare Verarbeitung von NGS-Daten
  • unsere umfassenden klinischen Aussagen

Testeinschränkungen

  • Gene mit eingeschränkter Abdeckung werden gekennzeichnet
  • Gene mit kompletten oder partiellen Duplikationen werden gekennzeichnet
  • es wird angenommen, dass ein Gen suboptimal abgedeckt ist, wenn >90% der Nukleotide des Gens bei einem Mapping-Qualitätsfaktor von >20 (MQ>20) nicht abgedeckt sind
  • die Sensitivität der Diagnostik zur Erkennung von Varianten mit genannten Testeinschränkungen ist möglicherweise begrenzt bei:
  • Gen-Konversionen
  • komplexe Inversionen
  • Balancierte Translokationen
  • Mitochondriale Varianten
  • Repeat-Expansionen, sofern nicht anders dokumentiert
  • nicht kodierende Varianten, die Krankheiten verursachen, die von diesem Panel nicht mit abgedeckt werden
  • niedriger Mosaik-Status
  • Repeat-Blöcke von Mononukleotiden
  • Indels >50bp (Insertionen-Deletionen)
  • Deletionen oder Duplikationen einzelner Exons
  • Varianten innerhalb von Pseudogenen
  • die analytische Sensitivität kann geringer ausfallen werden, wenn die DNA nicht von amedes genetics extrahiert wurde

Laboratory requirement

  • Die in grün gezeigten Gene sind kuratiert und werden als Gen-Panel untersucht. Eine Erweiterung des Panels (blau gezeigte Gene, jeweils ebenfalls kuratiert) kann auf Anfrage erfolgen. Sofern unter "Erweitertes Panel" ein Minuszeichen angezeigt wird, sind nur Core-/Basis-Gene verfügbar.

  • Für die Anforderung einer genetischen Untersuchung senden Sie uns bitte die Krankheits-ID auf einem Überweisungsschein. Bitte die Material-Angabe beachten.

  • Für privat versicherte Patienten empfehlen wir einen Antrag auf Kostenübernahme bei der Krankenversicherung.

  • Die Untersuchung wird auch für Selbstzahler angeboten.