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Klinische FragestellungLippen-Kiefer-Gaumen-[Gesichts-]Spalten, nicht-syndromal; Differentialdiagnose

Zusammenfassung

Kurzinformation

Ein umfassendes differentialdiagnostisches panel mit über 50 kuratierten Genen für genetisch bedingte Lippen-Kiefer-Gaumen-[Gesichts-]Spalten, nicht-syndromal

ID
LP6465
Anzahl Gene
54 Akkreditierte Untersuchung
Untersuchte Sequenzlänge
54,5 kb (Core-/Core-canditate-Gene)
111,6 kb (Erweitertes Panel: inkl. additional genes)
Analyse-Dauer
auf Anfrage
Material
  • EDTA-Blut (3-5 ml)
Diagnostische Hinweise

NGS +

 

Genpanel

Ausgewählte Gene

NameExon-Länge (bp)OMIM-GReferenz-Seq.Erbgang
BCOR5166NM_017745.6XL
CDH12649NM_004360.5AD
COL11A15421NM_001854.4AD, AR
COL11A25211NM_080680.3AD, AR
COL2A14464NM_001844.5AD
EFNB11041NM_004429.5XL
FGFR12469NM_023110.3AD
FGFR22466NM_000141.5AD
FLNA7920NM_001456.4XL
GRHL31671NM_198174.3AD
IRF61404NM_006147.4AD
MSX1912NM_002448.3AD
OFD13039NM_003611.3XL
PHF83075NM_015107.3XLR
SOX91530NM_000346.4AD
TBX221563NM_001109878.2XL
TCOF14467NM_001135243.2AD
AHCY1299NM_000687.4AR
BHMT1221NM_001713.3n.k.
CRISPLD21557NM_031476.4Mult, Ass
CTH1122NM_001902.6AR
DHFR564NM_000791.4AR
DMGDH2601NM_013391.3AR
FOLH12160NM_001014986.3Mult, Ass
FOLR1774NM_016725.3AR
FOLR2797NM_000803.5Mult, Ass
FOLR3741NM_000804.4Mult, Ass
FOXE11122NM_004473.4n.k.
FTCD1626NM_006657.3AR
JAG23717NM_002226.5Mult, Ass
MAT1A1188NM_000429.3AD, AR
MAT2A1188NM_005911.6AD
MAT2B1103NM_013283.5Mult, Ass
MTHFD12808NM_005956.4AR
MTHFD21061NM_006636.4Mult, Ass
MTHFR1971NM_005957.5Mult, Ass
MTHFS441NM_001199758.1AR
MTR3798NM_000254.3AR
MTRR2097NM_002454.3AR
NOS33612NM_000603.5Mult
PAX71563NM_002584.3n.k.
PON11068NM_000446.7Sus
PQBP1798NM_005710.2XLR
ROCK14065NM_005406.3Mult, Ass
SHMT11452NM_004169.5Mult, Ass
SHMT21555NM_005412.6AR
SLC19A11470NM_001205206.4AR
SLC46A11297NM_001242366.3AR
SMS942NM_004595.5XLR
SUMO1306NM_003352.8isolierte Fälle
TCN21284NM_000355.4AR
TGFA563NM_001099691.3Mult, Ass
TGFB21245NM_003238.6AD
TYMS942NM_001071.4Mult, Ass

Infos zur Erkrankung

Klinischer Kommentar

Orofaziale Spalten sind die häufigsten orofazialen Fehlbildungen beim Menschen. In den ersten 6-10 Schwangerschaftswochen verschmelzen die Knochen und die Haut des fötalen Oberkiefers, der Nase und des Mundes normal miteinander und bilden das Mund-Dach und die Oberlippe. Spaltbildungen entstehen, wenn Teile der Lippe und/oder des Gaumens nicht vollständig miteinander verschmelzen. Die Gründe für die meisten Spaltbildungen sind nach wie vor unklar, einige können mit genetischen Faktoren zusammenhängen, andere mit Umweltfaktoren (Medikamente und Chemikalien während der Schwangerschaft, Mangel an wichtigen pränatalen Nährstoffen, Rauchen und Alkohol usw.). Ein erhöhtes Wiederholungsrisiko für Spaltbildungen bei Verwandten deutet auf ein hohes Maß an Erblichkeit hin. Monogene Ursachen sind aber die Ausnahme und umfassen Mutationen in Genen, die für Zellproliferation und -migration, Zell-Zell-Adhäsionsproteine, den Folat- und Homocystein-Stoffwechsel kodieren. Im Wesentlichen werden orofaziale Spaltbildungen als typische komplexe und multifaktorielle Erkrankungen betrachtet, die durch mehrere genetische und umweltbedingte Faktoren verursacht werden. Im Gegensatz zu verschiedenen Spaltbildungs-Syndromen übersteigt die molekulargenetische Ausbeute bei nicht-syndromalen Spalten in familiären Fällen kaum 10%. Daher sollten syndromale Spaltbildungsgene-Gene differenzialdiagnostisch mitberücksichtigt werden. Dennoch ist die klinische Diagnose selten von positiven DNA-Testergebnissen begleitet.

Referenz: https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fcell.2020.592271/full

https://richtlijnendatabase.nl/richtlijn/behandeling_van_patienten_met_een_schisis/diagnostic_genetic_testing_in_isolated_clefts_of_the_lip_alveolus_and_or_palate.html

 

Synonyme
  • Acampomelic campomelic dysplasia (SOX9)
  • Allelic: Abruzzo-Erickson syndrome (TBX22)
  • Allelic: Ectodermal dysplasia 3, Witkop type (MSX1)
  • Allelic: Joubert syndrome 10 (OFD1)
  • Allelic: Simpson-Golabi-Behmel syndrome, type 2 (OFD1)
  • Bamforth-Lazarus syndrome (FOXE1)
  • Blepharocheilodontic syndrome 1 (CDH1)
  • Campomelic dysplasia (SOX9)
  • Cerebellar ataxia, neuropathy + vestibular areflexia syndrome (RFC1)
  • Cleft palate with ankyloglossia (TBX22)
  • Combined immunodeficiency and megaloblastic anemia with or without hyperhomocysteinemia (MTHFD1)
  • Craniofrontonasal dysplasia (EFNB1)
  • Cystathioninuria (CTH)
  • Dimethylglycine dehydrogenase deficiency (DMGDH)
  • Folate malabsorption, hereditary (SLC46A1)
  • Frontometaphyseal dysplasia 1 (FLNA)
  • Gastric cancer, hereditary diffuse, with/-out cleft lip and/or palate (CDH1)
  • Glutamate formiminotransferase deficiency (FTCD)
  • Glycine N-methyltransferase deficiency (GNMT)
  • Homocystinuria due to MTHFR deficiency (MTHFR)
  • Homocystinuria, B6-responsive and nonresponsive types (CBS)
  • Homocystinuria-megaloblastic anemia, cbl E type (MTRR)
  • Homocystinuria-megaloblastic anemia, cblG complementation type (MTR)
  • Hypermethioninemia with deficiency of S-adenosylhomocysteine hydrolase (AHCY)
  • Jackson-Weiss syndrome (FGFR1, FGFR2)
  • Loeys-Dietz syndrome 4 (TGB2)
  • Marshall syndrome (COL11A1)
  • Megaloblastic anemia due to dihydrofolate reductase deficiency (DHFR)
  • Megaloblastic anemia, folate-responsive (SLC19A1)
  • Melnick-Needles syndrome (FLNA)
  • Mental retardation syndrome, XL, Siderius type (PHF8)
  • Mental retardation, XL, Snyder-Robinson type (SMS)
  • Methionine adenosyltransferase deficiency, AR (MAT1A)
  • Microphthalmia, syndromic 2 (BCOR)
  • Myopathy, congenital, progressive, with scoliosis (PAX7)
  • Neurodegeneration due to cerebral folate transport deficiency (FOLR1)
  • Neurodevelopmental disorder with cardiomyopathy, spasticity + brain abnormalities (SHMT2)
  • Neurodevelopmental disorder with microcephaly, epilepsy, and hypomyelination (MTHFS)
  • Orofacial cleft 10 (SUMO1)
  • Orofacial cleft 5 (MSX1)
  • Orofacial cleft 6 (IRF6)
  • Orofaciodigital syndrome I (OFD1)
  • Otopalatodigital syndrome, type I + II (FLNA)
  • Otospondylomegaepiphyseal dysplasia, AD (COL11A2)
  • Otospondylomegaepiphyseal dysplasia, AR (COL11A2)
  • Renpenning syndrome (PQBP1)
  • Stickler syndrome, type I (COL2A1)
  • Stickler syndrome, type II (COL11A1)
  • Tooth agenesis, selective, 1, with/-out orofacial cleft (MSX1)
  • Transcobalamin II deficiency (TCN2)
  • Treacher Collins syndrome 1 (TCOF1)
  • Van der Woude syndrome (IRF6)
  • Van der Woude syndrome 2 (GRHL3)
Erbgänge, Vererbungsmuster etc.
  • AD
  • AR
  • Ass
  • Mult
  • Sus
  • XL
  • XLR
  • isolierte Fälle
  • n.k.
OMIM-Ps
  • Multiple OMIM-Ps
ICD10 Code

Bioinformatik und klinische Interpretation

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